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Solanum lycopersicum gene Solyc07g045070.2
 Gene
 Gene
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| Name | Type | Organism | |
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Synonyms / aliases
Solyc07g045070
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Length
23,018
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Description
Ribosomal RNA small subunit methyltransferase B (AHRD V1 *-*- B4AE47_BACPU); contains Interpro domain(s) IPR001678 Bacterial Fmu (Sun)/eukaryotic nucleolar NOL1/Nop2p
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Location(s)
SL2.50ch07:58168992..58192009
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GFF source
ITAG_eugene
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- Length
- 23018
| Genome Viewer
Genome Viewer
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| Related features
Related features
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| Features that are parts of this gene |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| mRNA | Solyc07g045070.2.1 | SL2.50ch07:58168992..58192009 | 2,083 | - | n/a |
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| Genomic sequence
Genomic sequence
| unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>Solyc07g045070.2 SL2.50ch07:58192009..58168992 (sequence from reverse strand)
ATGCAGAAAGGGAGGGACTTCATCAAAGCCATTCGTAGAAGCTTCTTCACTCTCCACAGCAACACTTCCATTTCTCAGGTAACAAAACTCTCTTCTCTCTCTGTCTCTGCCGTAATCACACAGTTTAAACGGTTTATGCTGATATTGTGTACAGATGGATCAATCAACGCGTTACCATTACAGTCCAACTTTGAAATGGAACCCTACGGTTGAAGAATACTTCATCAAAGCTTACGGAGCTGATCATTTCTCTCGGATTTCAACTGCTCTCACGTATGCTATTTGCCTCATCTATCTTATACGTATTACTACCATTTTGCAATCTGTCATTTTCCACTTTACACGTTTTCTATTGTTATGTTATTTATTAGATAACTTTTACTTTAAATTTAGTAGTTGAGTTGTATTTTGAATTGATAAGAAGTTCTTAGATTTGATGTAATAGAGTTGAGCTCAATCTCTGTGTTTGTAGGTCCTGTTATTCAGTATTACAAATCTAATGCTAAGAAATTTTGGCAAAAATGAGATTGAGATAAATAAGAGATTAAGAGTAAAGGAATATTAGTAATTATATTCGTTATTAATGTGGCTTCAGAGTATTTCCTTTGTTTGTTTAGCAGAAGATGCTTGTAAGGAAAGTTGGAGCGTATAGCTGTTGTTAAATTCAAATTTGTGATAAAAATTCATTGTATTAGCACAAAGGAGTTTTCTACTGTGTTGTTTCATGTTATAGACTTGTTGCAATCTTTCACAATCTATACAAGTTTAGACTATTTTACTTTTGTCAATATCATCTTGGTACAGAAAGTTGAACAGAGTATTTCTATCACCGTTAATAAAATAAGTACTCCCCCTTTTGTTACGATTTCTTCTTGTTTCCAACTGTATATATAAACATGTTTCTTTGCTTTGTTTGTTATATTTGAACGCCTTAACTGCAGGCACGAAAAGTGTCCCTGATATTTCCTTTATGTTGTAGATGTTTCCTTCATGTGGGATTTCGGTGGTATGTTGTTATTGTATATGTTTCCTTCTAACATTCAAATGGTAATGCTTTTCTTAGGCGCCCATCATGTTACTCTTGTATCCGTGTGAATACGCTCAAATCAACAAGTGATGCTGTTATTGAGAAGCTTTTGGAAATTTTTAAGGAAAGAGGAATGCACGATGTTGCAGTTCAAGAATCTTCTACCACATGGGAGCCAGATAACTGTTGTAAGGCAACCTTAAAATGCACTGGAAGTGCAGAATCTCTTAAGGCCATCAAAAGTATCTCAAAGTGTCAATTTCCTGGCTTGGATTATGTGGTTTTTGTTAAAGGTTCAGGACCGCATGCAATTCATTATGGGGACAATGAAGGCAAACCTCTTAAGGAGGTAATTGTAAGCCGAAAGTGCGCAGAGGCAGTTCTTCGTGGTGCCCAAGTGAGTAATTGTTCAGACCTATATAAACCTAGTTAGCTATAGGAATTCACTTTGAGTTGAATGGAGAAGTTCATTGTCTTTCTCCCGTGTAACGTAGACAGTAGGTATATTTCAACCTGTAGATAGGAGGAAAAATGCCAAATCATGATGATATTTCTAACTTTTACCACGTGATGTGTTGTGTATGTAGTTGTCTATATTGCTGCTTAAGTACGTGCATGCAAATTCATGATGCTGTTCTTGATATATGAGAGTGTCTAACACTATGTTTGGATCATTGTTATCCATTGTATTGTATTGTATCGTTACTATGCCTACAATATTTGTTTTGATTGTTACTTAAAATGTATTGTATTGTATTGTTAAATTTCGTTGTTACGTAACAATGAAAATCCGTATTTTATGGAACAACCAATTTGGTGTGTTCTCATTGTTACTTAATTTCTTTTTCCAATTATATATTTACATAATATTTCAGAATACTATTTTACCCTTTATCTTAATTATTTAAATCTAGTCAAACTTACTTACCTAGAATAATTAGGATATTTTGTAAATTTATAAATTACAATACAATACAATATGATCAAACCAAACAATTAAAATATTATTAAACAACAACAAACAATACAATCTAGCCAAACATTGTATCTACATACAATACAGAACAATAAAATACAATACAATACAATACATTATGAAACAATGGGTAACAATGATCCAAACAAAGTGTAAGTGTTGTACATCCTTACGTATTATCTTCTCTATTATGTTAAAACACTTGACTGTTTTCCAGACAACATATATACCTGAGCTAATAAGACAAAGAAATTGAGAGTCTAAAGTCTATGGCTTGAATGAATCAGTAACAATGGATTAGTGGAAAGAGTTATTAAGAGATGCATAGGGAGGGAGTGATCCATCAATCATTAGTTGACCTTCCCGTTGAACCAGTGACGGTGCTTTCAGCAGAGCTGTTTAAGTTTTTGAATTCCATCTCTAGTTCTATTTGGAAGTATTTTCAGAAAGTGCACTGGAAAAGAACTTACAAAGAAGGAAAAATAGAAAAAAAATCATAATAGAAGAAGGAAATGTACTGTTGCATAAATTGGAGGACTTCTAAGAATTAAGGTCATGCAATTATGTGAGTATCATATTTGACAATTTGTTCTTCTCTTAATTTATACTGTCTTATTCAGGGGTGTAAATTTTGACTGGTACTTCAATTAGTACTTACCCTTCTTCTCCATCTATGCACATTTTATCTGGAGCTATGTAATAGGCTCATACCTTTGTCAAGATTAGTGACATCTTGACCTTCAATATCACTTGATATTATGCATTAGTTTTTTTTGTCTATAGGGGCACAAATATACCAACAGGAGACGCATGTTCCTGCAAGTTGGCAATTACCAAAACAATGGCATTGGAACACCGGGAGATTTTCTTCTTTGATTTGCTAGAACTTTCTTGTAAAGAGTGCATGTGCTTTTGTTAAATTACAAATTAGTACCTGACACAATCTTACCATCTACTCGTCATATTTCCCAGGTGTATGTGCCTGGTGTTTTGGCATGCAGTGCTCATGTTGAAAGAGGTGATGCAGTTGCAGTATCAGTTGCTGTGGAACAGTATGGTCCAGATGGTGGATGGGGTGTTGCAATGACACGCGGGACTGTTTTACAAGGATCACAGGAAGGTAATTTAACTTCTTGTTTAGCACCTTTTCATATCCAATAAAGGGTACTTTCTGAATTCTTATACTGATTTGACCCCAAAGGCATTAATGTGTTCCTCTGTGGAAAAGTTTGCTGAGGAACTTACTATTTCTTTGACATAAACTTGACATGTACGTGTCACTGTAGTATACATTTTGGTCTTGCTTTTGGTGTTTCCTCATTTTCACTTTTGCCCATATATGACAGTGCATCAGTTAATTAATGATTTTGTATGGGTAACATTTGCATCAATTTGTAGTTTTTTAACAAGGTTAAAGCTTATTATTGAATGGGCATCAGGAAGATGTCAAGTTACAAAAGGTGTGACCAATTAGCTTTAGTACAGAAGGGCAAAAAATAAATGAATTTCAGCACTAGCAAGTAGCCTAAGCTAAAGCTAAGGAGCTAACAAAATCCAAAAACATGTCAACTCTATTGACAAGTGAAAGAAAATTCCAACTGAACAGATAAACTAAACACTTAATCTTTAGAGAGTGGGTAGGAATTGAAATTCCATCAAAGTATCTGCAATTCCTTTCATTCCAGATAACCCAATAATGGATTGCTGGGATCATCCTCCAGACTTTTTTGATGGCTTTGTCAACTCTCCAAGAGATTCAGCTGATGCAGGACTCCTTCTTCGACCTGGGCATGCTCCAGGAAAGGCCATATAAAGATAAGAAGAAGTTCAAAATATCGTTGTGATAGGGCAGTGCGTGAATAGGCGGCTTACACTCTCAAGATTCTTGTTTGCATATATAACATCTGTTTACTAGAGTAATTTTCCTTCTGCTAACATTATCTAGTGTCAAGTAAGCATTATTGAGAGCTGCCCAGGCCAAGCATGTAAGTTTGATTGGTATCCTGGTCCTCCAGAGTCCAGACATGCTTCCATGACCAATCCTCCAGAATTCCACCCTGTGAACTTATTAGATCGTAACTTTCCTTGACTGTGTATTCCCCCTTTTTAGATGTAGCCCAAATGATTTTGTCTACTTGGTAAGCCAGTTGGTTTCCAACTAGAGTTAGAACTGGGTGTAAGCCAGTTGGGTTGATGCAGAAAATGTTTCATTTTCTGGGGTGACAGTATGCGCTTAATGCACAAAATTCAGATATTTATTTCTCAATGAATGAGAATCTCCTTAATGTGATAGTCATTGACTCCTTATTTTGGCGAATTTCTTGCAAATGAGAATCTAGTTTTGCGGTAAGATATTTGAACTATTAGCTTCATCTCACACCAATGTAATCTGGAAGGTTTTTAATGTTTTCAGAATCCTTCTCAGATGATTATGGTGGGACATACTGCATTTTTATGGTTAAATACCAAGATAATTTTTCATCTAGTCTGATTTTGTGGATACAAGTTTGCTATGTTCTTTTTTATTTATTACTTGCAAAAAAGGTATGCTCTGGTCTTTCTGAAATATACTCCAGATCTGCTTGATTTGTTGAAATGTTGTCTTCTCTCTTACACAATCAAATTTTGCAGTATATAAAATCTATGGCATCTTTTTATTATTTTAAAGTTGTATGACATCCATCCAGCCAATTGAGTGACTAATCTCAGTTTCGATTAGATCCTTATTATTTTGAAAGAGATGGCTTCTACATTGGCCAAGCAACAGCAATGATGTCAAGAGCTGGGATGTTTCGTGTTACTGAGGGGGTTGCGGTGGATATGAAGGAAAGAGTATACAGACTACCCTCCTTTTATGGTATAAGTTTCTCGCCTTCTCCAGTATTTTTTGAAATCATTTACAGGATATTATGTGCATAAATCTTTATGGCATACTCTGGTTTGTCACACTTGATGATGAGAATCTGCTTCAACTTAATAAATGTTGTTACCATCTCG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>Solyc07g045070.2.1 Ribosomal RNA small subunit methyltransferase B (AHRD V1 *-*- B4AE47_BACPU); contains Interpro domain(s) IPR001678 Bacterial Fmu (Sun)/eukaryotic nucleolar NOL1/Nop2p
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ATGCAGAAAGGGAGGGACTTCATCAAAGCCATTCGTAGAAGCTTCTTCACTCTCCACAGCAACACTTCCATTTCTCAGATGGATCAATCAACGCGTTACCATTACAGTCCAACTTTGAAATGGAACCCTACGGTTGAAGAATACTTCATCAAAGCTTACGGAGCTGATCATTTCTCTCGGATTTCAACTGCTCTCACGCGCCCATCATGTTACTCTTGTATCCGTGTGAATACGCTCAAATCAACAAGTGATGCTGTTATTGAGAAGCTTTTGGAAATTTTTAAGGAAAGAGGAATGCACGATGTTGCAGTTCAAGAATCTTCTACCACATGGGAGCCAGATAACTGTTGTAAGGCAACCTTAAAATGCACTGGAAGTGCAGAATCTCTTAAGGCCATCAAAAGTATCTCAAAGTGTCAATTTCCTGGCTTGGATTATGTGGTTTTTGTTAAAGGTTCAGGACCGCATGCAATTCATTATGGGGACAATGAAGGCAAACCTCTTAAGGAGGTAATTGTAAGCCGAAAGTGCGCAGAGGCAGTTCTTCGTGGTGCCCAAGTGTATGTGCCTGGTGTTTTGGCATGCAGTGCTCATGTTGAAAGAGGTGATGCAGTTGCAGTATCAGTTGCTGTGGAACAGTATGGTCCAGATGGTGGATGGGGTGTTGCAATGACACGCGGGACTGTTTTACAAGGATCACAGGAAGATCCTTATTATTTTGAAAGAGATGGCTTCTACATTGGCCAAGCAACAGCAATGATGTCAAGAGCTGGGATGTTTCGTGTTACTGAGGGGGTTGCGGTGGATATGAAGGAAAGAGTATACAGACTACCCTCCTTTTATGATTTGCTTGAGGGCGAGATTTTTCTTCAGAACCTTCCAAGCATAATAACTGCACATGCCTTAGATCCTCAACCAGGAGAGAGAATATTGGACATGTGTGCAGCTCCAGGGGGGAAAACCACAGCAATAGCAAGCCTTATGAAGGACAAAGGGGAGGTTGTTGCTGTTGACAGATCTCATAATAAGGTGCTTGGAATTCAGAAATTAGCGGCTGAGATGGGTTTAAGCTGTATAACTACATATAAGCTTGACGCGCTGAAGTCTGTTTGCCATGGAGCTGAATCTGATAGTTTGCCTTACACATGCAGTGCTGAGGATGCGCGAACACCAGATTTATTATCCACTGGTATAGATGGATTTGATGCAGAGTTGCTATTCGAAAAGAATTTCAATGATTTGCAGCTGAAGGATGGTCAGTACCCTAGTAAAGCTGAACTACGAAAACGTATTAGGCAACTAAAAAATGGGCCAGGAAGGAATCACACTGCTGGTGGGAGGGTTGAAAAGTCTAAAGGGTTTTCTCCCAATAGCTTTGATCGTGTGCTGCTTGATGCTCCTTGCTCTGCATTAGGTTTAAGACCTCGTCTCTTTGCTGGAGAGGACACAGTTGATTCCTTGAGGAGTAATGCCAAATATCAGAGACGAATGTTTGACCAAGCTGTCCAGCTTGTTCGTCCAGGTGGAGTCATTGTCTATTCCACATGTACGATAAACCCTGGTGAGAATGAAGCATTGGTTCGATATGCATTGGACAAATATGAGTTTCTCTCGTTGGCATCTCAGCATCCAAAAATTGGAGGACCTGGCCTTACTGGTAGTTGTCAATTGTCTGATGGATTTGTTGAGGAATGGTTAAAGCCCGGTGAAGAAGATCTTGTTCAGAGATTTGATCCATCATCCGACCTTGATACAATAGGATTTTTCATAGCTAAGTTCAGTGTTGGACCCAAAAATATCCGAGTTGAATGTGACGCGAAGTCTGGGAACAGGTGATTCGGCAGTGAAATTACATTAACTTCGATGATATTAGTTCAGGCCTCTCCTTGTTGTCAACAACATGCTGGAATGTGGGTTGCAGAATTAGTTAATGTAACTGTGAATGCAAGATAGAGTATTAAAGATATTTCAACCTTGCATATTGGTCATGATTTTATTTTATTTTACCCCTGTACTGATTTTATTTTTAACCTCTCTTTAATTATTTGTTTATTTAGCTGGAGTATCAATTTTTACATAGCCT
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Protein sequence
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>Solyc07g045070.2.1 Ribosomal RNA small subunit methyltransferase B (AHRD V1 *-*- B4AE47_BACPU); contains Interpro domain(s) IPR001678 Bacterial Fmu (Sun)/eukaryotic nucleolar NOL1/Nop2p
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| Features this mRNA is a part of |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
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| Features that are parts of this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
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