This site uses cookies to provide logins and other features. Please accept the use of cookies by clicking Accept.
Potato locus 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase
Locus details | Download GMOD XML | Note to Editors | Annotation guidelines |
[loading edit links...]
|
[loading...]
|
|
Registry name: | None | [Associate registry name] |
![]() ![]() | [Add notes, figures or images] |
Image | Description | Type |
---|
![]() ![]() | [Associate accession] |
Accession name:
Would you Like to specify an allele?
Alleles (0) | None | [Add new Allele] |
![]() ![]() | [Associate new locus] |
[loading...]
|
Associated loci - graphical view | None |
![]() ![]() |
[loading...]
![]() ![]() |
![]() ![]() |
![]() ![]() | unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>PGSC0003DMG400029178 PGSC_DMv3_219_ch07:43255969..43261236
CTTAAATAGATTGGATGGATTGAGCTTTATTTTGGCACCCCCTAATTTCATTTCATTTAGTGTTGATGGCGATCAATGACGATGGCTTTGGTTGATTATATAGTATGAAAGTTTGAATATTTTTGCTTTGCAGAATCGTGTTGTCATCAAGATCACTTTCTTCTCCTTTCATACCAAAATCTCGTTATGGATCAAGTTATGGCTGCTATTATCAAGAAATCGGTCATTTGAGGCTTCAATTCCCCCAACCCATTTGGACTGTAGAAACAGTTTCTCAAGTCTTAAGATCAATCCCCAGATTCCTCTTCCAATCCCCCAAGATCCATTGGCCGACAAAATGGGTTTCGCCACCGTACCCCATTAAAGCAGAGAAACCTAAACCAAGAGTTCTATAACACTCGGAAGGGAGTGCTCATTCTTGGCCCAGCTGCTCATAGAGATGCTCAAAAGGTACAATTAGGATTGGAGAAAGCATTGGAATTTTTCCATTGGGTTGAGACCCGCTGTGGGTTTACTCACAATGAGCTCACTTGCAGAGAAATGTCTCTTGTTCTTGCCAAAGGGTCTTGTAATTCGAAGCTTCTTTGGGAATTTCTCAAAAGAATGTCGAGAAGAGGGCTTTTGACGACACCGACCGTTACGTGTTTGATAAAATGCCTAGGAGAAGAAGGGTTGGTAAATGAAGCATTGACTACTTTCTACAGAATGAAGCAATTTCACTGTAAGCCTGATGTTTATGCTTACAACACACTCATATTTGCTCTTTGTAGAGTTGGGAATTTCAAAAAAGCTAAGTTCTTGATGGAGCAAATGGAGTTGCCTGGTTTTAGGTGTCCACCTGATGTCTTTACTTACACAATCTTGATTAGCTCTTATTGTAGATATGGTATGGAAACTGGCTGTAGAAAAGCTATTAGACGGAGAATATGGGAGGCGAATCACTTGTTTCGTATCATGCTATTCAAAGGATTTGTTCCTGATGTAGTAACTTATAATAGTTTGATCAATGGATGCTGCAAAACTAATAGGATAGAGAGAGCATTGGAGTTGTTGGATGATATGGTGAAAAGAGGGGTTGTGCCTAATCGAATTACGTATAATTCTTTCATTAGGTATTATAGTGTTACAAATGAGATTGATAAGGCTATTGAAATGCTGAGAAGAATGCAAGGAATGAATCATGGAGTAGTACTACCATGTAACAGTTCGTATACACCGATAATTCATGCTATGTGTGAAACTGGTAGGGTGGTGGAGGCAAGAGATCTTCTTGTCGAATTGGCTGAACAAGGTTCGATTCCAAGAGAATATACTTTTAAACTAGTTCGTGATGCTTTAGAATCTTCTGGGAAGATTGATTTGCTTGATGAAGAATTGTGTACAAGATTAGAAGATGGTATTAAAGGTAGGATTAGACAAGTGATGAAAGTAAAACCTTTGTTGCAGCATCAAAGTGTTTCATAGCATTGAATTTTATACTTTTTATCTATGTTTGCTCAGACTCTTTGAAAATGTTGATGGATGCGTGTCGAATTCTCCAAAAATAGTGTATTTTTGGAGAATTTGACACGAATGCAGCATCGAAAGTGAAGAGTCTGCACAACTTAGCTTTTTGTGGATTTTGATCTTATAAAAGCACAAGGGATTTAACTTATATACTGTAATTCTCTATATATAGAAGCGGCTTGGAAGCAGCTGGCCGTTGTCCTGCCAACTTGCTGTCCAAGGGCTTTTTGGTCATTCCAGGTATTAGGGTAGTACGTGTTAGGTACTGCTGCTACACGTGTAACGTCATAACGTAGCTTCAAGATGAGAAAAGAAAGTCCGCAGTTTCAACTTCTTCTATCTAATTGTTCTCTGTTTCTGCCATATCTTTATCACCGCCTTCGTTTCTTCTTCGATTTGAGCTTCTTTGTTATCTCAGGTGAGCTTTGAATTCATTGTCAGTGTTTTGTACTAATTTAATGATGTTATTGTGATGAAGCTTGTAGAAATTAGGTTTTAAGATATACAGTATATGTCTGCAGATAAAAAATCAATGGTACCAACTTCTTCTTAAATTGCTGTGTTATTTTTTAATTATTTATCTTTTTTCCTCATAATGTGGTGCATGTATGCAAGATTTTTTTTTTTTTCTCTGCTGCTGTTAATTTGAAGAGAGGGGGGGGAGGGGGGCTTAAATCACGGGTAAAGAGTTATATCCCTATGTGACCTATAATTCATGGGTTCGAGCACTAAAATTAGTCATTAGCTTACATTATGATATATATTAGTATTAGTCATAGCTTACATTAAGATATATATTAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACATTAGGATGACCTATAAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATGCTTACATTAGGATGACCAGTAAGTCATTGGTTAGAGCACTAAATTAGTCATAACTTGCATTAAGATGACCTATAAATCATCGGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACGTTAGAATGGCCTATAAGTCATGGGTTCGAGCAGTAAAATTAGTCATATTTTACATTAGGATAGGCTACCTACATCGTCCAAAGGCGGAGCTAGAATTTAGAGTCTTTTTGAAAAAGAAAATGATATTACTCAACAGAGAGAGCTTTTAAAATAAGGACCAGGAGGCATGATTTACATACATAATTATCACATGATACAAAAAGAGATGTTTTTATCACACCAACGAAGAAAAAAACTTCAATCAGTAACTAAGTCTTACACGTGTTAAATTCTTAAGTCAGCTGCGTCATCTGTCTCTGAACATGGTTGTCGCTTCATTATGTATGTAATTGTGTGTTTTGGCTTTGGTTTTACCTCCGTTTCGTCTTCAGATTGATCGAGGTTTTCATCTTCAGCTGATTCTTTAATTTCTTGCCATTGTTTCCTTCAATCTCTTGGACAAATTAGGTTTTATGACAACGCTTGCAGTTGTTACTGCCATGGGCTTACAGATTACGGAAATTAGGTCTTAGGAGCTAATCGTTTTTCAAATCTTTGTTTGTTGTGTGAATTCTTTGTGCTGCAAAATCTTTTCTAATTTGCCTTTAACTCGATCTCTTTGAGCTGCAAAATCTTTTCTCATTTGCCTTTAACTCGATCGTGTTGGAGTTGGACAACTTTTTCTCCTCCGAGTTTGCTCCTGTTTGCAAGAGCTTTAATTTATTGTGAGACTTCCCTATGTTATTTCTGTGCAATTACTGAAGCAACTATGAGACCTTGACAGAACATAGGAGCTGCAATTTTTGTATACATTATACGGTGACATATGCTAACTGACGTGTTCAGTAATAGTTTAGCAACTTCATCGATTGTTCATTCATGTGGTATATATTATTGGTTTAAAGGATGCTCAATCTCCTCATTTCCTGTTGTCTTTGTTTTGGTTTTCCAACTTCGTTATCATTGTACGAGATGTCATCAGATAAAAAAATGATGGCACCAACTTATTCCTCCCAAAAAAGAAAGCATCATTAGTCAGCAGAAAGAGCTTCTAAAACTAAGCTCAGAAGACTTGATCTGTATGCACAGTTGTCAATTGACAAAAAAGAAATGCTTTTATCGCGGTGACGAGTGAAAAATGTTGATTCAGCAAGCTGCTGTCTCTTGGTTGAGTGAACGAAAGAAGCATCATGTTTTGGAGTTGGTGTTGATTTACCTAGACAGCAAGCTCTAGCGATAAGAGAATCATCTTCCGCTGCCAAAAAAGGTCAGATCCCAAAAATACAATATACTATTTAGAATGTATGTTGCTTATAATTTTACTTGTATATACATTGTTAATGTTAAGCAAGATTTCTGCCCCACAGTAGCTGATACATCTTTCAATTATTTATTTAGTAGCCTTTATATGCCTTTACTTTAGGATGGTTGATAATTGATTTCTTTATATAATTGAAATTTACAGGCGTTAAGTTAGGTATCACTGCAGCCCTTTAATTTTGACATTTGTATAAGATGGTTCAGGTTTGGTTGTTCAGATAAACTTGAACAAAGTTGATTTGAAAATGACAACATCCAGTTGATTTGAATTTGAATAAAGTCTCATGTAAACTTCATATGGGACACTGAAAAATACCCCATAAAGAGTAATGGAGATGTGCAGAGGTGTATTCCTTGCACTTTCATCGATCTTTGTTGGGATTTCTGTTTTCTTTCTCCGCTTCTTCATCTTCCTCCCATTCTCTCTGTGCTTGACCTGCTTCTTCCACTTCGTTCACTTATTTCAGGTAATATCTCCTTCAGATTTCTTGTGATTTGCCCTCAATCTATAATTTCCTCTGGCTAGCCTTTCTACTTTCCTGCTTGTGTTGAATTCTGGTCATTTATAAGCGTATTCTTGCTACTTCGGATGCAAATTAATTGGTGTAGCTTCCATAGTTTTATCCTGTTCTCCTACCTTCCTATTTAATAATAGAATTAACATGGATTATGATTGACTCGCTATTGATCTCTCTGTATATGATACGTACTAATGCCTTTCTAAATTCTCTAAGAACATGAAATTGGAATGTTCTTCACCAATAAGGATTAATAACACCCCCAATCTAGGTCACATTTGATCTTCTCCTGTCTCTTTGATCTGATTCAAACAAATTCTCCAAGCTAGAAAGATGCACATTACTGCTTATTCTTTTCCTTGTCATACTGCCAGCCTTCTTTTCAAATTCATTGGGGTCAACTATATGAATCCTTAATAGCTATTGTGTTCTATTCAAGCCTGTCTTGGTGGAAGGTCTGTTCAGAGAGTATATTTGATTGTGTGCTTCTTATGAACCAGATAAATTGCATCTCACATTGTTGGGTATCCCTGGACCCAAAGAAAAAGCTGAAATTTGCTCTCGAGTCTTTCTGGGATGGAAAGAGCAGTGCTGAGGATTCAGTCATCCACCTGAAAACACGTCTGATGCAGGCATTAAGTACATCCCAGCAACACATTCTCTCGACACAACCGCAATGCTTGGTGCCATCCCATAATCAGGCGAATTTTTGGGATGCTTAGTGCCATCCCAAAAATACTGTCCACCCGGGCCTATTCTTACTAGTACTGTATGGAATTGCTGGCTATAAGTGTATTTTAATATGTTTTACACCAACTTTTACCTTATATGTCAGGTTGCTAATTTCACTTATGCATTCATTGTAATTATCATTTAGTTGACATAATAATGTAAAAACTCATTCATTGATAGAAGTTAATCAAAAGATCATGGATTCTAGACGTTAC
CTTAAATAGATTGGATGGATTGAGCTTTATTTTGGCACCCCCTAATTTCATTTCATTTAGTGTTGATGGCGATCAATGACGATGGCTTTGGTTGATTATATAGTATGAAAGTTTGAATATTTTTGCTTTGCAGAATCGTGTTGTCATCAAGATCACTTTCTTCTCCTTTCATACCAAAATCTCGTTATGGATCAAGTTATGGCTGCTATTATCAAGAAATCGGTCATTTGAGGCTTCAATTCCCCCAACCCATTTGGACTGTAGAAACAGTTTCTCAAGTCTTAAGATCAATCCCCAGATTCCTCTTCCAATCCCCCAAGATCCATTGGCCGACAAAATGGGTTTCGCCACCGTACCCCATTAAAGCAGAGAAACCTAAACCAAGAGTTCTATAACACTCGGAAGGGAGTGCTCATTCTTGGCCCAGCTGCTCATAGAGATGCTCAAAAGGTACAATTAGGATTGGAGAAAGCATTGGAATTTTTCCATTGGGTTGAGACCCGCTGTGGGTTTACTCACAATGAGCTCACTTGCAGAGAAATGTCTCTTGTTCTTGCCAAAGGGTCTTGTAATTCGAAGCTTCTTTGGGAATTTCTCAAAAGAATGTCGAGAAGAGGGCTTTTGACGACACCGACCGTTACGTGTTTGATAAAATGCCTAGGAGAAGAAGGGTTGGTAAATGAAGCATTGACTACTTTCTACAGAATGAAGCAATTTCACTGTAAGCCTGATGTTTATGCTTACAACACACTCATATTTGCTCTTTGTAGAGTTGGGAATTTCAAAAAAGCTAAGTTCTTGATGGAGCAAATGGAGTTGCCTGGTTTTAGGTGTCCACCTGATGTCTTTACTTACACAATCTTGATTAGCTCTTATTGTAGATATGGTATGGAAACTGGCTGTAGAAAAGCTATTAGACGGAGAATATGGGAGGCGAATCACTTGTTTCGTATCATGCTATTCAAAGGATTTGTTCCTGATGTAGTAACTTATAATAGTTTGATCAATGGATGCTGCAAAACTAATAGGATAGAGAGAGCATTGGAGTTGTTGGATGATATGGTGAAAAGAGGGGTTGTGCCTAATCGAATTACGTATAATTCTTTCATTAGGTATTATAGTGTTACAAATGAGATTGATAAGGCTATTGAAATGCTGAGAAGAATGCAAGGAATGAATCATGGAGTAGTACTACCATGTAACAGTTCGTATACACCGATAATTCATGCTATGTGTGAAACTGGTAGGGTGGTGGAGGCAAGAGATCTTCTTGTCGAATTGGCTGAACAAGGTTCGATTCCAAGAGAATATACTTTTAAACTAGTTCGTGATGCTTTAGAATCTTCTGGGAAGATTGATTTGCTTGATGAAGAATTGTGTACAAGATTAGAAGATGGTATTAAAGGTAGGATTAGACAAGTGATGAAAGTAAAACCTTTGTTGCAGCATCAAAGTGTTTCATAGCATTGAATTTTATACTTTTTATCTATGTTTGCTCAGACTCTTTGAAAATGTTGATGGATGCGTGTCGAATTCTCCAAAAATAGTGTATTTTTGGAGAATTTGACACGAATGCAGCATCGAAAGTGAAGAGTCTGCACAACTTAGCTTTTTGTGGATTTTGATCTTATAAAAGCACAAGGGATTTAACTTATATACTGTAATTCTCTATATATAGAAGCGGCTTGGAAGCAGCTGGCCGTTGTCCTGCCAACTTGCTGTCCAAGGGCTTTTTGGTCATTCCAGGTATTAGGGTAGTACGTGTTAGGTACTGCTGCTACACGTGTAACGTCATAACGTAGCTTCAAGATGAGAAAAGAAAGTCCGCAGTTTCAACTTCTTCTATCTAATTGTTCTCTGTTTCTGCCATATCTTTATCACCGCCTTCGTTTCTTCTTCGATTTGAGCTTCTTTGTTATCTCAGGTGAGCTTTGAATTCATTGTCAGTGTTTTGTACTAATTTAATGATGTTATTGTGATGAAGCTTGTAGAAATTAGGTTTTAAGATATACAGTATATGTCTGCAGATAAAAAATCAATGGTACCAACTTCTTCTTAAATTGCTGTGTTATTTTTTAATTATTTATCTTTTTTCCTCATAATGTGGTGCATGTATGCAAGATTTTTTTTTTTTTCTCTGCTGCTGTTAATTTGAAGAGAGGGGGGGGAGGGGGGCTTAAATCACGGGTAAAGAGTTATATCCCTATGTGACCTATAATTCATGGGTTCGAGCACTAAAATTAGTCATTAGCTTACATTATGATATATATTAGTATTAGTCATAGCTTACATTAAGATATATATTAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACATTAGGATGACCTATAAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATGCTTACATTAGGATGACCAGTAAGTCATTGGTTAGAGCACTAAATTAGTCATAACTTGCATTAAGATGACCTATAAATCATCGGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACGTTAGAATGGCCTATAAGTCATGGGTTCGAGCAGTAAAATTAGTCATATTTTACATTAGGATAGGCTACCTACATCGTCCAAAGGCGGAGCTAGAATTTAGAGTCTTTTTGAAAAAGAAAATGATATTACTCAACAGAGAGAGCTTTTAAAATAAGGACCAGGAGGCATGATTTACATACATAATTATCACATGATACAAAAAGAGATGTTTTTATCACACCAACGAAGAAAAAAACTTCAATCAGTAACTAAGTCTTACACGTGTTAAATTCTTAAGTCAGCTGCGTCATCTGTCTCTGAACATGGTTGTCGCTTCATTATGTATGTAATTGTGTGTTTTGGCTTTGGTTTTACCTCCGTTTCGTCTTCAGATTGATCGAGGTTTTCATCTTCAGCTGATTCTTTAATTTCTTGCCATTGTTTCCTTCAATCTCTTGGACAAATTAGGTTTTATGACAACGCTTGCAGTTGTTACTGCCATGGGCTTACAGATTACGGAAATTAGGTCTTAGGAGCTAATCGTTTTTCAAATCTTTGTTTGTTGTGTGAATTCTTTGTGCTGCAAAATCTTTTCTAATTTGCCTTTAACTCGATCTCTTTGAGCTGCAAAATCTTTTCTCATTTGCCTTTAACTCGATCGTGTTGGAGTTGGACAACTTTTTCTCCTCCGAGTTTGCTCCTGTTTGCAAGAGCTTTAATTTATTGTGAGACTTCCCTATGTTATTTCTGTGCAATTACTGAAGCAACTATGAGACCTTGACAGAACATAGGAGCTGCAATTTTTGTATACATTATACGGTGACATATGCTAACTGACGTGTTCAGTAATAGTTTAGCAACTTCATCGATTGTTCATTCATGTGGTATATATTATTGGTTTAAAGGATGCTCAATCTCCTCATTTCCTGTTGTCTTTGTTTTGGTTTTCCAACTTCGTTATCATTGTACGAGATGTCATCAGATAAAAAAATGATGGCACCAACTTATTCCTCCCAAAAAAGAAAGCATCATTAGTCAGCAGAAAGAGCTTCTAAAACTAAGCTCAGAAGACTTGATCTGTATGCACAGTTGTCAATTGACAAAAAAGAAATGCTTTTATCGCGGTGACGAGTGAAAAATGTTGATTCAGCAAGCTGCTGTCTCTTGGTTGAGTGAACGAAAGAAGCATCATGTTTTGGAGTTGGTGTTGATTTACCTAGACAGCAAGCTCTAGCGATAAGAGAATCATCTTCCGCTGCCAAAAAAGGTCAGATCCCAAAAATACAATATACTATTTAGAATGTATGTTGCTTATAATTTTACTTGTATATACATTGTTAATGTTAAGCAAGATTTCTGCCCCACAGTAGCTGATACATCTTTCAATTATTTATTTAGTAGCCTTTATATGCCTTTACTTTAGGATGGTTGATAATTGATTTCTTTATATAATTGAAATTTACAGGCGTTAAGTTAGGTATCACTGCAGCCCTTTAATTTTGACATTTGTATAAGATGGTTCAGGTTTGGTTGTTCAGATAAACTTGAACAAAGTTGATTTGAAAATGACAACATCCAGTTGATTTGAATTTGAATAAAGTCTCATGTAAACTTCATATGGGACACTGAAAAATACCCCATAAAGAGTAATGGAGATGTGCAGAGGTGTATTCCTTGCACTTTCATCGATCTTTGTTGGGATTTCTGTTTTCTTTCTCCGCTTCTTCATCTTCCTCCCATTCTCTCTGTGCTTGACCTGCTTCTTCCACTTCGTTCACTTATTTCAGGTAATATCTCCTTCAGATTTCTTGTGATTTGCCCTCAATCTATAATTTCCTCTGGCTAGCCTTTCTACTTTCCTGCTTGTGTTGAATTCTGGTCATTTATAAGCGTATTCTTGCTACTTCGGATGCAAATTAATTGGTGTAGCTTCCATAGTTTTATCCTGTTCTCCTACCTTCCTATTTAATAATAGAATTAACATGGATTATGATTGACTCGCTATTGATCTCTCTGTATATGATACGTACTAATGCCTTTCTAAATTCTCTAAGAACATGAAATTGGAATGTTCTTCACCAATAAGGATTAATAACACCCCCAATCTAGGTCACATTTGATCTTCTCCTGTCTCTTTGATCTGATTCAAACAAATTCTCCAAGCTAGAAAGATGCACATTACTGCTTATTCTTTTCCTTGTCATACTGCCAGCCTTCTTTTCAAATTCATTGGGGTCAACTATATGAATCCTTAATAGCTATTGTGTTCTATTCAAGCCTGTCTTGGTGGAAGGTCTGTTCAGAGAGTATATTTGATTGTGTGCTTCTTATGAACCAGATAAATTGCATCTCACATTGTTGGGTATCCCTGGACCCAAAGAAAAAGCTGAAATTTGCTCTCGAGTCTTTCTGGGATGGAAAGAGCAGTGCTGAGGATTCAGTCATCCACCTGAAAACACGTCTGATGCAGGCATTAAGTACATCCCAGCAACACATTCTCTCGACACAACCGCAATGCTTGGTGCCATCCCATAATCAGGCGAATTTTTGGGATGCTTAGTGCCATCCCAAAAATACTGTCCACCCGGGCCTATTCTTACTAGTACTGTATGGAATTGCTGGCTATAAGTGTATTTTAATATGTTTTACACCAACTTTTACCTTATATGTCAGGTTGCTAATTTCACTTATGCATTCATTGTAATTATCATTTAGTTGACATAATAATGTAAAAACTCATTCATTGATAGAAGTTAATCAAAAGATCATGGATTCTAGACGTTAC
Download sequence region |
Get flanking sequences on PGSC_DMv3_219_ch07
|
![]() ![]() |
Ontology terms | None | terms associated with this mRNA |
![]() ![]() | spliced cDNA sequence, including UTRs |
>PGSC0003DMT400075018 Pentatricopeptide repeat-containing protein
CTTAAATAGATTGGATGGATTGAGCTTTATTTTGGCACCCCCTAATTTCATTTCATTTAGTGTTGATGGCGATCAATGACGATGGCTTTGGTTGATTATATAGTATGAAAGTTTGAATATTTTTGCTTTGCAGAATCGTGTTGTCATCAAGATCACTTTCTTCTCCTTTCATACCAAAATCTCGTTATGGATCAAGTTATGGCTGCTATTATCAAGAAATCGGTCATTTGAGGCTTCAATTCCCCCAACCCATTTGGACTGTAGAAACAGTTTCTCAAGTCTTAAGATCAATCCCCAGATTCCTCTTCCAATCCCCCAAGATCCATTGGCCGACAAAATGGGTTTCGCCACCGTACCCCATTAAAGCAGAGAAACCTAAACCAAGAGTTCTATAACACTCGGAAGGGAGTGCTCATTCTTGGCCCAGCTGCTCATAGAGATGCTCAAAAGGTACAATTAGGATTGGAGAAAGCATTGGAATTTTTCCATTGGGTTGAGACCCGCTGTGGGTTTACTCACAATGAGCTCACTTGCAGAGAAATGTCTCTTGTTCTTGCCAAAGGGTCTTGTAATTCGAAGCTTCTTTGGGAATTTCTCAAAAGAATGTCGAGAAGAGGGCTTTTGACGACACCGACCGTTACGTGTTTGATAAAATGCCTAGGAGAAGAAGGGTTGGTAAATGAAGCATTGACTACTTTCTACAGAATGAAGCAATTTCACTGTAAGCCTGATGTTTATGCTTACAACACACTCATATTTGCTCTTTGTAGAGTTGGGAATTTCAAAAAAGCTAAGTTCTTGATGGAGCAAATGGAGTTGCCTGGTTTTAGGTGTCCACCTGATGTCTTTACTTACACAATCTTGATTAGCTCTTATTGTAGATATGGTATGGAAACTGGCTGTAGAAAAGCTATTAGACGGAGAATATGGGAGGCGAATCACTTGTTTCGTATCATGCTATTCAAAGGATTTGTTCCTGATGTAGTAACTTATAATAGTTTGATCAATGGATGCTGCAAAACTAATAGGATAGAGAGAGCATTGGAGTTGTTGGATGATATGGTGAAAAGAGGGGTTGTGCCTAATCGAATTACGTATAATTCTTTCATTAGGTATTATAGTGTTACAAATGAGATTGATAAGGCTATTGAAATGCTGAGAAGAATGCAAGGAATGAATCATGGAGTAGTACTACCATGTAACAGTTCGTATACACCGATAATTCATGCTATGTGTGAAACTGGTAGGGTGGTGGAGGCAAGAGATCTTCTTGTCGAATTGGCTGAACAAGGTTCGATTCCAAGAGAATATACTTTTAAACTAGTTCGTGATGCTTTAGAATCTTCTGGGAAGATTGATTTGCTTGATGAAGAATTGTGTACAAGATTAGAAGATGGTATTAAAGGTAGGATTAGACAAGTGATGAAAGTAAAACCTTTGTTGCAGCATCAAAGTGTTTCATAGCATTGAATTTTATACTTTTTATCTATGTTTGCTCAGACTCTTTGAAAATGTTGATGGATGCGTGTCGAATTCTCCAAAAATAGTGTATTTTTGGAGAATTTGACACGAATGCAGCATCGAAAGTGAAGAGTCTGCACAACTTAGCTTTTTGTGGATTTTGATCTTATAAAAGCACAAGGGATTTAACTTATATACTGTAATTCTCTATATATAGAAGCGGCTTGGAAGCAGCTGGCCGTTGTCCTGCCAACTTGCTGTCCAAGGGCTTTTTGGTCATTCCAGGTATTAGGGTAGTACGTGTTAGGTACTGCTGCTACACGTGTAACGTCATAACGTAGCTTCAAGATGAGAAAAGAAAGTCCGCAGTTTCAACTTCTTCTATCTAATTGTTCTCTGTTTCTGCCATATCTTTATCACCGCCTTCGTTTCTTCTTCGATTTGAGCTTCTTTGTTATCTCAGGTGAGCTTTGAATTCATTGTCAGTGTTTTGTACTAATTTAATGATGTTATTGTGATGAAGCTTGTAGAAATTAGGTTTTAAGATATACAGTATATGTCTGCAGATAAAAAATCAAT
CTTAAATAGATTGGATGGATTGAGCTTTATTTTGGCACCCCCTAATTTCATTTCATTTAGTGTTGATGGCGATCAATGACGATGGCTTTGGTTGATTATATAGTATGAAAGTTTGAATATTTTTGCTTTGCAGAATCGTGTTGTCATCAAGATCACTTTCTTCTCCTTTCATACCAAAATCTCGTTATGGATCAAGTTATGGCTGCTATTATCAAGAAATCGGTCATTTGAGGCTTCAATTCCCCCAACCCATTTGGACTGTAGAAACAGTTTCTCAAGTCTTAAGATCAATCCCCAGATTCCTCTTCCAATCCCCCAAGATCCATTGGCCGACAAAATGGGTTTCGCCACCGTACCCCATTAAAGCAGAGAAACCTAAACCAAGAGTTCTATAACACTCGGAAGGGAGTGCTCATTCTTGGCCCAGCTGCTCATAGAGATGCTCAAAAGGTACAATTAGGATTGGAGAAAGCATTGGAATTTTTCCATTGGGTTGAGACCCGCTGTGGGTTTACTCACAATGAGCTCACTTGCAGAGAAATGTCTCTTGTTCTTGCCAAAGGGTCTTGTAATTCGAAGCTTCTTTGGGAATTTCTCAAAAGAATGTCGAGAAGAGGGCTTTTGACGACACCGACCGTTACGTGTTTGATAAAATGCCTAGGAGAAGAAGGGTTGGTAAATGAAGCATTGACTACTTTCTACAGAATGAAGCAATTTCACTGTAAGCCTGATGTTTATGCTTACAACACACTCATATTTGCTCTTTGTAGAGTTGGGAATTTCAAAAAAGCTAAGTTCTTGATGGAGCAAATGGAGTTGCCTGGTTTTAGGTGTCCACCTGATGTCTTTACTTACACAATCTTGATTAGCTCTTATTGTAGATATGGTATGGAAACTGGCTGTAGAAAAGCTATTAGACGGAGAATATGGGAGGCGAATCACTTGTTTCGTATCATGCTATTCAAAGGATTTGTTCCTGATGTAGTAACTTATAATAGTTTGATCAATGGATGCTGCAAAACTAATAGGATAGAGAGAGCATTGGAGTTGTTGGATGATATGGTGAAAAGAGGGGTTGTGCCTAATCGAATTACGTATAATTCTTTCATTAGGTATTATAGTGTTACAAATGAGATTGATAAGGCTATTGAAATGCTGAGAAGAATGCAAGGAATGAATCATGGAGTAGTACTACCATGTAACAGTTCGTATACACCGATAATTCATGCTATGTGTGAAACTGGTAGGGTGGTGGAGGCAAGAGATCTTCTTGTCGAATTGGCTGAACAAGGTTCGATTCCAAGAGAATATACTTTTAAACTAGTTCGTGATGCTTTAGAATCTTCTGGGAAGATTGATTTGCTTGATGAAGAATTGTGTACAAGATTAGAAGATGGTATTAAAGGTAGGATTAGACAAGTGATGAAAGTAAAACCTTTGTTGCAGCATCAAAGTGTTTCATAGCATTGAATTTTATACTTTTTATCTATGTTTGCTCAGACTCTTTGAAAATGTTGATGGATGCGTGTCGAATTCTCCAAAAATAGTGTATTTTTGGAGAATTTGACACGAATGCAGCATCGAAAGTGAAGAGTCTGCACAACTTAGCTTTTTGTGGATTTTGATCTTATAAAAGCACAAGGGATTTAACTTATATACTGTAATTCTCTATATATAGAAGCGGCTTGGAAGCAGCTGGCCGTTGTCCTGCCAACTTGCTGTCCAAGGGCTTTTTGGTCATTCCAGGTATTAGGGTAGTACGTGTTAGGTACTGCTGCTACACGTGTAACGTCATAACGTAGCTTCAAGATGAGAAAAGAAAGTCCGCAGTTTCAACTTCTTCTATCTAATTGTTCTCTGTTTCTGCCATATCTTTATCACCGCCTTCGTTTCTTCTTCGATTTGAGCTTCTTTGTTATCTCAGGTGAGCTTTGAATTCATTGTCAGTGTTTTGTACTAATTTAATGATGTTATTGTGATGAAGCTTGTAGAAATTAGGTTTTAAGATATACAGTATATGTCTGCAGATAAAAAATCAAT
![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>PGSC0003DMT400075018 Pentatricopeptide repeat-containing protein
MSLVLAKGSCNSKLLWEFLKRMSRRGLLTTPTVTCLIKCLGEEGLVNEALTTFYRMKQFHCKPDVYAYNTLIFALCRVGNFKKAKFLMEQMELPGFRCPPDVFTYTILISSYCRYGMETGCRKAIRRRIWEANHLFRIMLFKGFVPDVVTYNSLINGCCKTNRIERALELLDDMVKRGVVPNRITYNSFIRYYSVTNEIDKAIEMLRRMQGMNHGVVLPCNSSYTPIIHAMCETGRVVEARDLLVELAEQGSIPREYTFKLVRDALESSGKIDLLDEELCTRLEDGIKGRIRQVMKVKPLLQHQSVS*
MSLVLAKGSCNSKLLWEFLKRMSRRGLLTTPTVTCLIKCLGEEGLVNEALTTFYRMKQFHCKPDVYAYNTLIFALCRVGNFKKAKFLMEQMELPGFRCPPDVFTYTILISSYCRYGMETGCRKAIRRRIWEANHLFRIMLFKGFVPDVVTYNSLINGCCKTNRIERALELLDDMVKRGVVPNRITYNSFIRYYSVTNEIDKAIEMLRRMQGMNHGVVLPCNSSYTPIIHAMCETGRVVEARDLLVELAEQGSIPREYTFKLVRDALESSGKIDLLDEELCTRLEDGIKGRIRQVMKVKPLLQHQSVS*
![]() ![]() |
Ontology terms | None | terms associated with this mRNA |
![]() ![]() | spliced cDNA sequence, including UTRs |
>PGSC0003DMT400075019 Pentatricopeptide repeat-containing protein
CTTAAATAGATTGGATGGATTGAGCTTTATTTTGGCACCCCCTAATTTCATTTCATTTAGTGTTGATGGCGATCAATGACGATGGCTTTGGTTGATTATATAGTATGAAAGTTTGAATATTTTTGCTTTGCAGAATCGTGTTGTCATCAAGATCACTTTCTTCTCCTTTCATACCAAAATCTCGTTATGGATCAAGTTATGGCTGCTATTATCAAGAAATCGGTCATTTGAGGCTTCAATTCCCCCAACCCATTTGGACTGTAGAAACAGTTTCTCAAGTCTTAAGATCAATCCCCAGATTCCTCTTCCAATCCCCCAAGATCCATTGGCCGACAAAATGGGTTTCGCCACCGTACCCCATTAAAGCAGAGAAACCTAAACCAAGAGTTCTATAACACTCGGAAGGGAGTGCTCATTCTTGGCCCAGCTGCTCATAGAGATGCTCAAAAGGTACAATTAGGATTGGAGAAAGCATTGGAATTTTTCCATTGGGTTGAGACCCGCTGTGGGTTTACTCACAATGAGCTCACTTGCAGAGAAATGTCTCTTGTTCTTGCCAAAGGGTCTTGTAATTCGAAGCTTCTTTGGGAATTTCTCAAAAGAATGTCGAGAAGAGGGCTTTTGACGACACCGACCGTTACGTGTTTGATAAAATGCCTAGGAGAAGAAGGGTTGGTAAATGAAGCATTGACTACTTTCTACAGAATGAAGCAATTTCACTGTAAGCCTGATGTTTATGCTTACAACACACTCATATTTGCTCTTTGTAGAGTTGGGAATTTCAAAAAAGCTAAGTTCTTGATGGAGCAAATGGAGTTGCCTGGTTTTAGGTGTCCACCTGATGTCTTTACTTACACAATCTTGATTAGCTCTTATTGTAGATATGGTATGGAAACTGGCTGTAGAAAAGCTATTAGACGGAGAATATGGGAGGCGAATCACTTGTTTCGTATCATGCTATTCAAAGGATTTGTTCCTGATGTAGTAACTTATAATAGTTTGATCAATGGATGCTGCAAAACTAATAGGATAGAGAGAGCATTGGAGTTGTTGGATGATATGGTGAAAAGAGGGGTTGTGCCTAATCGAATTACGTATAATTCTTTCATTAGGTATTATAGTGTTACAAATGAGATTGATAAGGCTATTGAAATGCTGAGAAGAATGCAAGGAATGAATCATGGAGTAGTACTACCATGTAACAGTTCGTATACACCGATAATTCATGCTATGTGTGAAACTGGTAGGGTGGTGGAGGCAAGAGATCTTCTTGTCGAATTGGCTGAACAAGGTTCGATTCCAAGAGAATATACTTTTAAACTAGTTCGTGATGCTTTAGAATCTTCTGGGAAGATTGATTTGCTTGATGAAGAATTGTGTACAAGATTAGAAGATGGTATTAAAGGTAGGATTAGACAAGTGATGAAAGTAAAACCTTTGTTGCAGCATCAAAGTGTTTCATAGCATTGAATTTTATACTTTTTATCTATGTTTGCTCAGACTCTTTGAAAATGTTGATGGATGCGTGTCGAATTCTCCAAAAATAGTGTATTTTTGGAGAATTTGACACGAATGCAGCATCGAAAGTGAAGAGTCTGCACAACTTAGCTTTTTGTGGATTTTGATCTTATAAAAGCACAAGGGATTTAACTTATATACTGTAATTCTCTATATATAGAAGCGGCTTGGAAGCAGCTGGCCGTTGTCCTGCCAACTTGCTGTCCAAGGGCTTTTTGGTCATTCCAGGTATTAGGGTAGTACGTGTTAGGTACTGCTGCTACACGTGTAACGTCATAACGTAGCTTCAAGATGAGAAAAGAAAGTCCGCAGTTTCAACTTCTTCTATCTAATTGTTCTCTGTTTCTGCCATATCTTTATCACCGCCTTCGTTTCTTCTTCGATTTGAGCTTCTTTGTTATCTCAGCAAGCTGCTGTCTCTTGGTTGAGTGAACGAAAGAAGCATCATGTTTTGGAGTTGGTGTTGATTTACCTAGACAGCAAGCTCTAGCGATAAGAGAATCATCTTCCGCTGCCAAAAAAGATAAATTGCATCTCACATTGTTGGGTATCCCTGGACCCAAAGAAAAAGCTGAAATTTGCTCTCGAGTCTTTCTGGGATGGAAAGAGCAGTGCTGAGGATTCAGTCATCCACCTGAAAACACGTCTGATGCAGGCATTAAGTACATCCCAGCAACACATTCTCTCGACACAACCGCAATGCTTGGTGCCATCCCATAATCAGGCGAATTTTTGGGATGCTTAGTGCCATCCCAAAAATACTGTCCACCCGGGCCTATTCTTACTAGTACTGTATGGAATTGCTGGCTATAAGTGTATTTTAATATGTTTTACACCAACTTTTACCTTATATGTCAGGTTGCTAATTTCACTTATGCATTCATTGTAATTATCATTTAGTTGACATAATAATGTAAAAACTCATTCATTGATAGAAGTTAATCAAAAGATCATGGATTCTAGACGTTAC
CTTAAATAGATTGGATGGATTGAGCTTTATTTTGGCACCCCCTAATTTCATTTCATTTAGTGTTGATGGCGATCAATGACGATGGCTTTGGTTGATTATATAGTATGAAAGTTTGAATATTTTTGCTTTGCAGAATCGTGTTGTCATCAAGATCACTTTCTTCTCCTTTCATACCAAAATCTCGTTATGGATCAAGTTATGGCTGCTATTATCAAGAAATCGGTCATTTGAGGCTTCAATTCCCCCAACCCATTTGGACTGTAGAAACAGTTTCTCAAGTCTTAAGATCAATCCCCAGATTCCTCTTCCAATCCCCCAAGATCCATTGGCCGACAAAATGGGTTTCGCCACCGTACCCCATTAAAGCAGAGAAACCTAAACCAAGAGTTCTATAACACTCGGAAGGGAGTGCTCATTCTTGGCCCAGCTGCTCATAGAGATGCTCAAAAGGTACAATTAGGATTGGAGAAAGCATTGGAATTTTTCCATTGGGTTGAGACCCGCTGTGGGTTTACTCACAATGAGCTCACTTGCAGAGAAATGTCTCTTGTTCTTGCCAAAGGGTCTTGTAATTCGAAGCTTCTTTGGGAATTTCTCAAAAGAATGTCGAGAAGAGGGCTTTTGACGACACCGACCGTTACGTGTTTGATAAAATGCCTAGGAGAAGAAGGGTTGGTAAATGAAGCATTGACTACTTTCTACAGAATGAAGCAATTTCACTGTAAGCCTGATGTTTATGCTTACAACACACTCATATTTGCTCTTTGTAGAGTTGGGAATTTCAAAAAAGCTAAGTTCTTGATGGAGCAAATGGAGTTGCCTGGTTTTAGGTGTCCACCTGATGTCTTTACTTACACAATCTTGATTAGCTCTTATTGTAGATATGGTATGGAAACTGGCTGTAGAAAAGCTATTAGACGGAGAATATGGGAGGCGAATCACTTGTTTCGTATCATGCTATTCAAAGGATTTGTTCCTGATGTAGTAACTTATAATAGTTTGATCAATGGATGCTGCAAAACTAATAGGATAGAGAGAGCATTGGAGTTGTTGGATGATATGGTGAAAAGAGGGGTTGTGCCTAATCGAATTACGTATAATTCTTTCATTAGGTATTATAGTGTTACAAATGAGATTGATAAGGCTATTGAAATGCTGAGAAGAATGCAAGGAATGAATCATGGAGTAGTACTACCATGTAACAGTTCGTATACACCGATAATTCATGCTATGTGTGAAACTGGTAGGGTGGTGGAGGCAAGAGATCTTCTTGTCGAATTGGCTGAACAAGGTTCGATTCCAAGAGAATATACTTTTAAACTAGTTCGTGATGCTTTAGAATCTTCTGGGAAGATTGATTTGCTTGATGAAGAATTGTGTACAAGATTAGAAGATGGTATTAAAGGTAGGATTAGACAAGTGATGAAAGTAAAACCTTTGTTGCAGCATCAAAGTGTTTCATAGCATTGAATTTTATACTTTTTATCTATGTTTGCTCAGACTCTTTGAAAATGTTGATGGATGCGTGTCGAATTCTCCAAAAATAGTGTATTTTTGGAGAATTTGACACGAATGCAGCATCGAAAGTGAAGAGTCTGCACAACTTAGCTTTTTGTGGATTTTGATCTTATAAAAGCACAAGGGATTTAACTTATATACTGTAATTCTCTATATATAGAAGCGGCTTGGAAGCAGCTGGCCGTTGTCCTGCCAACTTGCTGTCCAAGGGCTTTTTGGTCATTCCAGGTATTAGGGTAGTACGTGTTAGGTACTGCTGCTACACGTGTAACGTCATAACGTAGCTTCAAGATGAGAAAAGAAAGTCCGCAGTTTCAACTTCTTCTATCTAATTGTTCTCTGTTTCTGCCATATCTTTATCACCGCCTTCGTTTCTTCTTCGATTTGAGCTTCTTTGTTATCTCAGCAAGCTGCTGTCTCTTGGTTGAGTGAACGAAAGAAGCATCATGTTTTGGAGTTGGTGTTGATTTACCTAGACAGCAAGCTCTAGCGATAAGAGAATCATCTTCCGCTGCCAAAAAAGATAAATTGCATCTCACATTGTTGGGTATCCCTGGACCCAAAGAAAAAGCTGAAATTTGCTCTCGAGTCTTTCTGGGATGGAAAGAGCAGTGCTGAGGATTCAGTCATCCACCTGAAAACACGTCTGATGCAGGCATTAAGTACATCCCAGCAACACATTCTCTCGACACAACCGCAATGCTTGGTGCCATCCCATAATCAGGCGAATTTTTGGGATGCTTAGTGCCATCCCAAAAATACTGTCCACCCGGGCCTATTCTTACTAGTACTGTATGGAATTGCTGGCTATAAGTGTATTTTAATATGTTTTACACCAACTTTTACCTTATATGTCAGGTTGCTAATTTCACTTATGCATTCATTGTAATTATCATTTAGTTGACATAATAATGTAAAAACTCATTCATTGATAGAAGTTAATCAAAAGATCATGGATTCTAGACGTTAC
![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>PGSC0003DMT400075019 Pentatricopeptide repeat-containing protein
MSLVLAKGSCNSKLLWEFLKRMSRRGLLTTPTVTCLIKCLGEEGLVNEALTTFYRMKQFHCKPDVYAYNTLIFALCRVGNFKKAKFLMEQMELPGFRCPPDVFTYTILISSYCRYGMETGCRKAIRRRIWEANHLFRIMLFKGFVPDVVTYNSLINGCCKTNRIERALELLDDMVKRGVVPNRITYNSFIRYYSVTNEIDKAIEMLRRMQGMNHGVVLPCNSSYTPIIHAMCETGRVVEARDLLVELAEQGSIPREYTFKLVRDALESSGKIDLLDEELCTRLEDGIKGRIRQVMKVKPLLQHQSVS*
MSLVLAKGSCNSKLLWEFLKRMSRRGLLTTPTVTCLIKCLGEEGLVNEALTTFYRMKQFHCKPDVYAYNTLIFALCRVGNFKKAKFLMEQMELPGFRCPPDVFTYTILISSYCRYGMETGCRKAIRRRIWEANHLFRIMLFKGFVPDVVTYNSLINGCCKTNRIERALELLDDMVKRGVVPNRITYNSFIRYYSVTNEIDKAIEMLRRMQGMNHGVVLPCNSSYTPIIHAMCETGRVVEARDLLVELAEQGSIPREYTFKLVRDALESSGKIDLLDEELCTRLEDGIKGRIRQVMKVKPLLQHQSVS*
![]() ![]() |
Ontology terms | None | terms associated with this mRNA |
![]() ![]() | spliced cDNA sequence, including UTRs |
>PGSC0003DMT400075020 Pentatricopeptide repeat-containing protein
TAATTTGAAGAGAGGGGGGGGAGGGGGGCTTAAATCACGGGTAAAGAGTTATATCCCTATGTGACCTATAATTCATGGGTTCGAGCACTAAAATTAGTCATTAGCTTACATTATGATATATATTAGTATTAGTCATAGCTTACATTAAGATATATATTAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACATTAGGATGACCTATAAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATGCTTACATTAGGATGACCAGTAAGTCATTGGTTAGAGCACTAAATTAGTCATAACTTGCATTAAGATGACCTATAAATCATCGGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACGTTAGAATGGCCTATAAGTCATGGGTTCGAGCAGTAAAATTAGTCATATTTTACATTAGGATAGGCTACCTACATCGTCCAAAGGCGGAGCTAGAATTTAGAGTCTTTTTGAAAAAGAAAATGATATTACTCAACAGAGAGAGCTTTTAAAATAAGGACCAGGAGGCATGATTTACATACATAATTATCACATGATACAAAAAGAGATGTTTTTATCACACCAACGAAGAAAAAAACTTCAATCAGTAACTAAGTCTTACACGTGTTAAATTCTTAAGTCAGCTGCGTCATCTGTCTCTGAACATGGTTGTCGCTTCATTATGTATGTAATTGTGTGTTTTGGCTTTGGTTTTACCTCCGTTTCGTCTTCAGATTGATCGAGGTTTTCATCTTCAGCTGATTCTTTAATTTCTTGCCATTGTTTCCTTCAATCTCTTGGACAAATTAGGTTTTATGACAACGCTTGCAGTTGTTACTGCCATGGGCTTACAGATTACGGAAATTAGGTCTTAGGAGCTAATCGTTTTTCAAATCTTTGTTTGTTGTGTGAATTCTTTGTGCTGCAAAATCTTTTCTAATTTGCCTTTAACTCGATCTCTTTGAGCTGCAAAATCTTTTCTCATTTGCCTTTAACTCGATCGTGTTGGAGTTGGACAACTTTTTCTCCTCCGAGTTTGCTCCTGTTTGCAAGAGCTTTAATTTATTGTGAGACTTCCCTATGTTATTTCTGTGCAATTACTGAAGCAACTATGAGACCTTGACAGAACATAGGAGCTGCAATTTTTGTATACATTATACGGTGACATATGCTAACTGACGTGTTCAGTAATAGTTTAGCAACTTCATCGATTGTTCATTCATGTGGTATATATTATTGGTTTAAAGGATGCTCAATCTCCTCATTTCCTGTTGTCTTTGTTTTGGTTTTCCAACTTCGTTATCATTGTACGAGATGTCATCAGATAAAAAAATGATGGCACCAACTTATTCCTCCCAAAAAAGAAAGCATCATTAGTCAGCAGAAAGAGCTTCTAAAACTAAGCTCAGAAGACTTGATCTGTATGCACAGTTGTCAATTGACAAAAAAGAAATGCTTTTATCGCGGTGACGAGTGAAAAATGTTGATTCAGCAAGCTGCTGTCTCTTGGTTGAGTGAACGAAAGAAGCATCATGTTTTGGAGTTGGTGTTGATTTACCTAGACAGCAAGCTCTAGCGATAAGAGAATCATCTTCCGCTGCCAAAAAAGGTCAGATCCCAAAAATACAATATACTATTTAGAATGTATGTTGCTTATAATTTTACTTGTATATACATTGTTAATGTTAAGCAAGATTTCTGCCCCACAGTAGCTGATACATCTTTCAATTATTTATTTAGTAGCCTTTATATGCCTTTACTTTAGGATGGTTGATAATTGATTTCTTTATATAATTGAAATTTACAGGCGTTAAGTTAGGTATCACTGCAGCCCTTTAATTTTGACATTTGTATAAGATGGTTCAGGTTTGGTTGTTCAGATAAACTTGAACAAAGTTGATTTGAAAATGACAACATCCAGTTGATTTGAATTTGAATAAAGTCTCATGTAAACTTCATATGGGACACTGAAAAATACCCCATAAAGAGTAATGGAGATGTGCAGAGGTGTATTCCTTGCACTTTCATCGATCTTTGTTGGGATTTCTGTTTTCTTTCTCCGCTTCTTCATCTTCCTCCCATTCTCTCTGTGCTTGACCTGCTTCTTCCACTTCGTTCACTTATTTCAGGTAATATCTCCTTCAGATTTCTTGTGATTTGCCCTCAATCTATAATTTCCTCTGGCTAGCCTTTCTACTTTCCTGCTTGTGTTGAATTCTGGTCATTTATAAGCGTATTCTTGCTACTTCGGATGCAAATTAATTGGTGTAGCTTCCATAGTTTTATCCTGTTCTCCTACCTTCCTATTTAATAATAGAATTAACATGGATTATGATTGACTCGCTATTGATCTCTCTGTATATGATACGTACTAATGCCTTTCTAAATTCTCTAAGAACATGAAATTGGAATGTTCTTCACCAATAAGGATTAATAACACCCCCAATCTAGGTCACATTTGATCTTCTCCTGTCTCTTTGATCTGATTCAAACAAATTCTCCAAGCTAGAAAGATGCACATTACTGCTTATTCTTTTCCTTGTCATACTGCCAGCCTTCTTTTCAAATTCATTGGGGTCAACTATATGAATCCTTAATAGCTATTGTGTTCTATTCAAGCCTGTCTTGGTGGAAGGTCTGTTCAGAGAGTATATTTGATTGTGTGCTTCTTATGAACCAGATAAATTGCATCTCACATTGTTGGGTATCCCTGGACCCAAAGAAAAAGCTGAAATTTGCTCTCGAGTCTTTCTGGGATGGAAAGAGCAGTGCTGAGGATTCAGTCATCCACCTGAAAACACGTCTGATGCAGGCATTAAGTACATCCCAGCAACACATTCTCTCGACACAACCGCAATGCTTGGTGCCATCCCATAATCAGGCGAATTTTTGGGATGCTTAGTGCCATCCCAAAAATACTGTCCACCCGGGCCTATTCTTACTAGTACTGTATGGAATTGCTGGCTATAAGTGTATTTTAATATGTTTTACACCAACTTTTACCTTATATGTCAGGTTGCTAATTTCACTTATGCATTCATTGTAATTATCATTTAGTTGACATAATAATGTAAAAACTCATTCATTGATAGAAGTTAATCAAAAGATCATGGATTCTAGACGTTAC
TAATTTGAAGAGAGGGGGGGGAGGGGGGCTTAAATCACGGGTAAAGAGTTATATCCCTATGTGACCTATAATTCATGGGTTCGAGCACTAAAATTAGTCATTAGCTTACATTATGATATATATTAGTATTAGTCATAGCTTACATTAAGATATATATTAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACATTAGGATGACCTATAAGTCATGAGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATGCTTACATTAGGATGACCAGTAAGTCATTGGTTAGAGCACTAAATTAGTCATAACTTGCATTAAGATGACCTATAAATCATCGGTTTGAGTAGTAAAATTAGTCATAGCTTACGTTAGAATGGCCTATAAGTCATGGGTTCGAGCAGTAAAATTAGTCATATTTTACATTAGGATAGGCTACCTACATCGTCCAAAGGCGGAGCTAGAATTTAGAGTCTTTTTGAAAAAGAAAATGATATTACTCAACAGAGAGAGCTTTTAAAATAAGGACCAGGAGGCATGATTTACATACATAATTATCACATGATACAAAAAGAGATGTTTTTATCACACCAACGAAGAAAAAAACTTCAATCAGTAACTAAGTCTTACACGTGTTAAATTCTTAAGTCAGCTGCGTCATCTGTCTCTGAACATGGTTGTCGCTTCATTATGTATGTAATTGTGTGTTTTGGCTTTGGTTTTACCTCCGTTTCGTCTTCAGATTGATCGAGGTTTTCATCTTCAGCTGATTCTTTAATTTCTTGCCATTGTTTCCTTCAATCTCTTGGACAAATTAGGTTTTATGACAACGCTTGCAGTTGTTACTGCCATGGGCTTACAGATTACGGAAATTAGGTCTTAGGAGCTAATCGTTTTTCAAATCTTTGTTTGTTGTGTGAATTCTTTGTGCTGCAAAATCTTTTCTAATTTGCCTTTAACTCGATCTCTTTGAGCTGCAAAATCTTTTCTCATTTGCCTTTAACTCGATCGTGTTGGAGTTGGACAACTTTTTCTCCTCCGAGTTTGCTCCTGTTTGCAAGAGCTTTAATTTATTGTGAGACTTCCCTATGTTATTTCTGTGCAATTACTGAAGCAACTATGAGACCTTGACAGAACATAGGAGCTGCAATTTTTGTATACATTATACGGTGACATATGCTAACTGACGTGTTCAGTAATAGTTTAGCAACTTCATCGATTGTTCATTCATGTGGTATATATTATTGGTTTAAAGGATGCTCAATCTCCTCATTTCCTGTTGTCTTTGTTTTGGTTTTCCAACTTCGTTATCATTGTACGAGATGTCATCAGATAAAAAAATGATGGCACCAACTTATTCCTCCCAAAAAAGAAAGCATCATTAGTCAGCAGAAAGAGCTTCTAAAACTAAGCTCAGAAGACTTGATCTGTATGCACAGTTGTCAATTGACAAAAAAGAAATGCTTTTATCGCGGTGACGAGTGAAAAATGTTGATTCAGCAAGCTGCTGTCTCTTGGTTGAGTGAACGAAAGAAGCATCATGTTTTGGAGTTGGTGTTGATTTACCTAGACAGCAAGCTCTAGCGATAAGAGAATCATCTTCCGCTGCCAAAAAAGGTCAGATCCCAAAAATACAATATACTATTTAGAATGTATGTTGCTTATAATTTTACTTGTATATACATTGTTAATGTTAAGCAAGATTTCTGCCCCACAGTAGCTGATACATCTTTCAATTATTTATTTAGTAGCCTTTATATGCCTTTACTTTAGGATGGTTGATAATTGATTTCTTTATATAATTGAAATTTACAGGCGTTAAGTTAGGTATCACTGCAGCCCTTTAATTTTGACATTTGTATAAGATGGTTCAGGTTTGGTTGTTCAGATAAACTTGAACAAAGTTGATTTGAAAATGACAACATCCAGTTGATTTGAATTTGAATAAAGTCTCATGTAAACTTCATATGGGACACTGAAAAATACCCCATAAAGAGTAATGGAGATGTGCAGAGGTGTATTCCTTGCACTTTCATCGATCTTTGTTGGGATTTCTGTTTTCTTTCTCCGCTTCTTCATCTTCCTCCCATTCTCTCTGTGCTTGACCTGCTTCTTCCACTTCGTTCACTTATTTCAGGTAATATCTCCTTCAGATTTCTTGTGATTTGCCCTCAATCTATAATTTCCTCTGGCTAGCCTTTCTACTTTCCTGCTTGTGTTGAATTCTGGTCATTTATAAGCGTATTCTTGCTACTTCGGATGCAAATTAATTGGTGTAGCTTCCATAGTTTTATCCTGTTCTCCTACCTTCCTATTTAATAATAGAATTAACATGGATTATGATTGACTCGCTATTGATCTCTCTGTATATGATACGTACTAATGCCTTTCTAAATTCTCTAAGAACATGAAATTGGAATGTTCTTCACCAATAAGGATTAATAACACCCCCAATCTAGGTCACATTTGATCTTCTCCTGTCTCTTTGATCTGATTCAAACAAATTCTCCAAGCTAGAAAGATGCACATTACTGCTTATTCTTTTCCTTGTCATACTGCCAGCCTTCTTTTCAAATTCATTGGGGTCAACTATATGAATCCTTAATAGCTATTGTGTTCTATTCAAGCCTGTCTTGGTGGAAGGTCTGTTCAGAGAGTATATTTGATTGTGTGCTTCTTATGAACCAGATAAATTGCATCTCACATTGTTGGGTATCCCTGGACCCAAAGAAAAAGCTGAAATTTGCTCTCGAGTCTTTCTGGGATGGAAAGAGCAGTGCTGAGGATTCAGTCATCCACCTGAAAACACGTCTGATGCAGGCATTAAGTACATCCCAGCAACACATTCTCTCGACACAACCGCAATGCTTGGTGCCATCCCATAATCAGGCGAATTTTTGGGATGCTTAGTGCCATCCCAAAAATACTGTCCACCCGGGCCTATTCTTACTAGTACTGTATGGAATTGCTGGCTATAAGTGTATTTTAATATGTTTTACACCAACTTTTACCTTATATGTCAGGTTGCTAATTTCACTTATGCATTCATTGTAATTATCATTTAGTTGACATAATAATGTAAAAACTCATTCATTGATAGAAGTTAATCAAAAGATCATGGATTCTAGACGTTAC
![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>PGSC0003DMT400075020 Pentatricopeptide repeat-containing protein
MNQINCISHCWVSLDPKKKLKFALESFWDGKSSAEDSVIHLKTRLMQALSTSQQHILSTQPQCLVPSHNQANFWDA*
MNQINCISHCWVSLDPKKKLKFALESFWDGKSSAEDSVIHLKTRLMQALSTSQQHILSTQPQCLVPSHNQANFWDA*
![]() ![]() |
![]() ![]() | [Associate new unigene] |
Unigene ID:
[loading...]
![]() ![]() | [Associate new genbank sequence] |
Other genome matches | None |
![]() ![]() | [Associate publication] [Matching publications] |
Features of the hmg 1 subfamily of genes encoding HMG-CoA reductase in potato.
Plant molecular biology (1995)
Show / hide abstract
Show / hide abstract
3-Hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase (HMGR) catalyzes a key step in isoprenoid metabolism leading to a range of compounds that are important for the growth, development and health of the plant. We have isolated 7 classes of genomic clones encoding HMGR from a potato genomic library. Comparison of nucleic acid sequences reveals a high degree of identity between all seven classes of clones and the potato hmg 1 gene described by Choi et al. (Plant Cell 4: 1333, 1992), indicating that all are members of the same subfamily in potato. A representative member (hmg 1.2) of the most abundant class of genomic clones was selected for further characterization. Transgenic tobacco and potato containing the beta-glucuronidase (GUS) reporter gene under the control of the hmg 1.2 promoter expressed GUS activity constitutively at a low level in many plant tissues. High levels of GUS activity were observed only in the pollen. GUS assays of isolated pollen, correlations of GUS activity with the HMGR activity of anthers, hmg 1.2 promoter deletion studies, and segregation analysis of the expression of hmg 1.2::GUS among the R2 pollen of R1 progeny plants demonstrated that the hmg 1.2 promoter controls pollen expression.
Bhattacharyya, MK. Paiva, NL. Dixon, RA. Korth, KL. Stermer, BA.
Plant molecular biology.
1995.
28(1).
1-15.
![]() ![]() | [Add ontology annotations] |
[loading...]
![]() ![]() |
none found
User comments |
Please wait, checking for comments. (If comments do not show up, access them here)
Your Lists
Public Lists
List Contents
List Validation Failed
Elements not found:
Fuzzy Search Results
Synonym Search Results
Available Seedlots
Your Datasets
Public Datasets
Dataset Contents
Dataset Validation Failed
Elements not found:
Your Calendar
Having trouble viewing events on the calendar?
Are you associated with the breeding program you are interested in viewing?
Add New Event
Event Info
Attribute | Value |
---|---|
Project Name: | |
Start Date: | |
End Date: | |
Event Type: | |
Event Description: | |
Event Web URL: |
Edit Event
Login
Reset Password
To reset your password, please enter your email address. A link will be sent to that address with a link that will enable you to reset your password.
Create New User
Working
