Clone Read LE_HBa0004P13_T7_1513

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0004P13_T7_1513
Primer
T7
ID from Seq. Facility
LE_Hba_004_P13-T7
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
694 trimmed for vector and quality, 1136 raw
Genbank Accession
Sequence
>LE_HBa0004P13_T7_1513 (raw untrimmed)
GGCCCGGGTCCGGGGGGTCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTTGATTATATGCGAATTTGAATAAAGGTCAAACCATAATACAATCTTACCT
TATATTAAGAGTTAATAATTTTGATATTCACTTAATTATCAATTATTTTCAGAGAAAGTCATTCAACTTTTATTTTCAATTTAAAAGTCACTCAACTATG
ACTTCTTTGCACAGAAAGTCACCCAACCTGTTTACTTATTTTTTTAGAAAAAATTAGTGACATGAAATTTTAATATTAACAAAAATATAAGAATCAAAAT
ATAAATCCATTTAAAATATTTAATGACCCGCCCATTTAATCCAATCCACTAAAAATATGATATTAAACATTTTATTTTATCATTAATTCCCTAGATCATT
CTCCGTTGAACATTGAACATTTTATTTTACCATTAATTAGCTAAAAGAACATTGGAGACAAGGGAGAATGCTTTAGGGAATTAATGGTAAATTAAAATGT
TCAATATAATATTTTTAACGGGTCGGGTTAAATGGAGCGGATCATTATATGGGTATATATTCGACTCTCAAAATTTTGGTTAATAATTAAAATTCTATGT
CACCAATTTTAATGAAAAAAATTAATTAAATAGGTTGAGTGACTTTCTGTGTAAAGAAATCATAATTGAGTGACTTTTAAGTTGAAAATGAAAGTTAAGT
GACTTTCTGTACAACTAATTTATAATTGAGTAACTTTTGAGTTGAAAATAAAAGCTGAGTGACTGTGGAAACAATTGATATTCGAATTATTAACTCCTTA
TATTAGTGCCACAGATTGTATTCACATCCTAAATTTAAACTCCCGACTTTATTACTTAACCGTTTTAATTACACTAAGATTTTGGCCGGTATGAAGAAAA
ATAAATGCTAGAAGGTATAGTAATACTTCCATCCATGTAACCTTATGAGGAACTTTTATAGATCTGCTTTTGATTATTTTTGTTGTTGTAATACATGAAG
TCCGAATTTTATTATATTTTAAAGAATACTTGTTTTTCAACTCATGAATTTTAATAAAGGAGTTCTCTTTGTCTTCCTCTTGTATTCTGGTCGTGTACTG
CTTGCTTTGTTCATGATGTTTTTATTTAGGTATTCA
>LE_HBa0004P13_T7_1513 (trimmed for quality and cloning vector)
AGCTTTGATTATATGCGAATTTGAATAAAGGTCAAACCATAATACAATCTTACCTTATATTAAGAGTTAATAATTTTGATATTCACTTAATTATCAATTA
TTTTCAGAGAAAGTCATTCAACTTTTATTTTCAATTTAAAAGTCACTCAACTATGACTTCTTTGCACAGAAAGTCACCCAACCTGTTTACTTATTTTTTT
AGAAAAAATTAGTGACATGAAATTTTAATATTAACAAAAATATAAGAATCAAAATATAAATCCATTTAAAATATTTAATGACCCGCCCATTTAATCCAAT
CCACTAAAAATATGATATTAAACATTTTATTTTATCATTAATTCCCTAGATCATTCTCCGTTGAACATTGAACATTTTATTTTACCATTAATTAGCTAAA
AGAACATTGGAGACAAGGGAGAATGCTTTAGGGAATTAATGGTAAATTAAAATGTTCAATATAATATTTTTAACGGGTCGGGTTAAATGGAGCGGATCAT
TATATGGGTATATATTCGACTCTCAAAATTTTGGTTAATAATTAAAATTCTATGTCACCAATTTTAATGAAAAAAATTAATTAAATAGGTTGAGTGACTT
TCTGTGTAAAGAAATCATAATTGAGTGACTTTTAAGTTGAAAATGAAAGTTAAGTGACTTTCTGTACAACTAATTTATAATTGAGTAACTTTTG

Warnings:
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for chimera
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
5' read, flanking vector found
Quality trim threshold
12.5
Sequence entropy
0.895518
Expected error %
0.0947323
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0004P13
Clone
Clone name
hba-4p13
LE_HBa0004P13
C08HBa0004P13
P004P13
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
80,138
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found