Clone Read LE_HBa0086G06_SP6_23722

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0086G06_SP6_23722
Primer
SP6
ID from Seq. Facility
LE_HBa_086_G06-SP6
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
810 trimmed for vector and quality, 941 raw
Genbank Accession
Sequence
>LE_HBa0086G06_SP6_23722 (raw untrimmed)
ATAAAAAAATGGTTTNCNNCCGCTATGGTANTTTCAACATTTAAAATAATTAGTTTTATAAAATTCAAATAGATTGTATGCTAGCTTCATTAAATTTGTC
CCTTTTTTTAATTATAATTTTTAAGTAACATGTATGTTTTATATAGTTATGTATGTAATTAGAGTAATTTTATGAATATTCGTAAATCGTCTCAAAAGGA
TTTTGTTTAATTAAGTATTTGGCTTATTAGTTTAGTTTAAGCTATTGTCTATATATTGAATCAACTAATTTATTATTATGTTAATTGTTTTATTGTTAAG
ATTAACAAGCTCATTAATTGATTAATAACAATTCATTTTTAGCTTATTTTGACCGAATTCAACTAATTGCCTCGGTTTGATCGAAATAGCAATTCACATG
ATTATTTTTCTTAAGTCAAATTAACTACATTCTTGGCTTATTTTTCAAGACCTGTTTGCCTCAATAACCCAACAATTCTCACCCAATCCAATATCCCTCC
AAAGCCGACCCATTATAATACACAACCCAACTTAATTCTCCACGAAAGATTTAATCATATTCCTTTAAACATTCAATACAATCAGCAAATCTTGTTTGTT
GTTTTATTACTATCCGTCGACTATTTTCTTTGAAATTTCATGTGTTGATTTATGTCTTGTCGTGCCTTCTAATATGAATTTAAAATTAAGAATGTTATAT
CCATTGTTTGCTGCTAGAGTACTATGTTTTGAGGTACATTTTATTTGGTCTTCCTTACTTTCTCCTATCATACTCTCATTTTTAGTTAAATCTTTAGTCT
TTAGTTAATGCTTGGTTCAATTCTCTCTTTAATACTATTATTATCTAAATCTCTTGTGGATAGCCTCTAAGTTTATAGAAATTTGTAGCCGCTTGAGTAT
AAACCTGAAAAGTGTTAAGATTTATTTACATGCTTGATTCT
>LE_HBa0086G06_SP6_23722 (trimmed for quality and cloning vector)
ATTTAAAATAATTAGTTTTATAAAATTCAAATAGATTGTATGCTAGCTTCATTAAATTTGTCCCTTTTTTTAATTATAATTTTTAAGTAACATGTATGTT
TTATATAGTTATGTATGTAATTAGAGTAATTTTATGAATATTCGTAAATCGTCTCAAAAGGATTTTGTTTAATTAAGTATTTGGCTTATTAGTTTAGTTT
AAGCTATTGTCTATATATTGAATCAACTAATTTATTATTATGTTAATTGTTTTATTGTTAAGATTAACAAGCTCATTAATTGATTAATAACAATTCATTT
TTAGCTTATTTTGACCGAATTCAACTAATTGCCTCGGTTTGATCGAAATAGCAATTCACATGATTATTTTTCTTAAGTCAAATTAACTACATTCTTGGCT
TATTTTTCAAGACCTGTTTGCCTCAATAACCCAACAATTCTCACCCAATCCAATATCCCTCCAAAGCCGACCCATTATAATACACAACCCAACTTAATTC
TCCACGAAAGATTTAATCATATTCCTTTAAACATTCAATACAATCAGCAAATCTTGTTTGTTGTTTTATTACTATCCGTCGACTATTTTCTTTGAAATTT
CATGTGTTGATTTATGTCTTGTCGTGCCTTCTAATATGAATTTAAAATTAAGAATGTTATATCCATTGTTTGCTGCTAGAGTACTATGTTTTGAGGTACA
TTTTATTTGGTCTTCCTTACTTTCTCCTATCATACTCTCATTTTTAGTTAAATCTTTAGTCTTTAGTTAATGCTTGGTTCAATTCTCTCTTTAATACTAT
TATTATCTAA

Warnings:
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for chimera
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.895843
Expected error %
0.25243
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0086G06
Clone
Clone name
hba-86g6
LE_HBa0086G06
P086G06
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
23,235
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found