Clone Read LE_HBa0185D08_SP6_277731

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0185D08_SP6_277731
Primer
SP6
ID from Seq. Facility
LE_HBa_185_D08-SP6
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
473 trimmed for vector and quality, 976 raw
Sequence
>LE_HBa0185D08_SP6_277731 (raw untrimmed)
CATGATAAAGCTATGTCTCAGGATTCACTTGAATTTTGTGAATTAAGCTTCATTAAGGTATGGGTTCCTCACTCTTGGGATTTATTTCCCCAAAAGGTCA
TTTGAAAGTTCATTTTTAAATCACCCAATTCCAAGGGTTTTATCCTTTATATGTGTTTTCTACTAAAATTAAAATTTATGATTGATTATGTCTAATTGTT
ATTACCCATGGCTAATTAAGTATAAATTATTGAGTTATTGATGTTAATTAGGGGATTTTTGTGTGGATCATGTCCCTTTCCCCAATTTCCCCAAATATTG
GATCTTGCTTATGAATTGATGAAATTGAAGAATGTATTGATTGTTAAACTTGTTCTATCTATTATATTTCATTTATGGATAGAATAGGATAATGTATTGA
AGGAATTGGATCTAAATCTTGATGAATTCATGATGAACTCTATTCCCCCTAACCCTGGGATATGAATTGAGGTTAATTGGGATAGTGATGATACAATTGA
CTTACTGCTTGAGTAAATTACTATTGTATGATGTTGTTACACCTATTTATAGATGAATTTTCTATTGGCTGAGGTAAATACCTTAGATATTGGCTTTTTT
AAAGATAAATTCGTAAGATCTTAGTAAGATTTATATTTTTACTATAATATATAATAGATAACAATTCGTTAATAACTATCTTTTATACTCATCGCTCGTA
TTTATAATAATCTAACTTATTGATATTATAAATACAATCATATTACACTTCAATTAATCATTACAACTATTAATTTTTATATTTATTAAACATTTTATTT
AATTTGCTAATCTGAGCTACACATCTCCTTATAACATACCTTTACTTTTCAATATTATTCTTCATATACATAAATTTATCCTATTATATTTGTTTATAAT
ATATTATATCAAAAAGTGGTTTACTATATATATTATTAATAATCTTATCATTATTGTAACTAATACTATATAATTA
>LE_HBa0185D08_SP6_277731 (trimmed for quality and cloning vector)
TTGAATTTTGTGAATTAAGCTTCATTAAGGTATGGGTTCCTCACTCTTGGGATTTATTTCCCCAAAAGGTCATTTGAAAGTTCATTTTTAAATCACCCAA
TTCCAAGGGTTTTATCCTTTATATGTGTTTTCTACTAAAATTAAAATTTATGATTGATTATGTCTAATTGTTATTACCCATGGCTAATTAAGTATAAATT
ATTGAGTTATTGATGTTAATTAGGGGATTTTTGTGTGGATCATGTCCCTTTCCCCAATTTCCCCAAATATTGGATCTTGCTTATGAATTGATGAAATTGA
AGAATGTATTGATTGTTAAACTTGTTCTATCTATTATATTTCATTTATGGATAGAATAGGATAATGTATTGAAGGAATTGGATCTAAATCTTGATGAATT
CATGATGAACTCTATTCCCCCTAACCCTGGGATATGAATTGAGGTTAATTGGGATAGTGATGATACAATTGAC

Warnings:
  • Not screened for chimera
  • Not screened for repetitive elements
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.899607
Expected error %
0.264873
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0185D08
Clone
Clone name
hba-185d8
LE_HBa0185D08
P185D08
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
not yet estimated
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found