Clone Read LE_HBa0244F11_T7_378873

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0244F11_T7_378873
Primer
T7
ID from Seq. Facility
LE_HBa_244_F11-T7
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
530 trimmed for vector and quality, 879 raw
Sequence
>LE_HBa0244F11_T7_378873 (raw untrimmed)
NNTTACTGTAGGGGATCTCTGAGTGACCTGCAGGCATGCAAGCTTCGGTAAGTCTTCATTCATTATCCTTATAAAGGGAANANNNANAAAANANAANANA
NANAANATCCGTTTAGGGATTTNAATAAAANAGAAN
TTGAATTATAATGTTATAATATTTATGAAAATTGTTTTGTNTTTTCCCCCTTTTGTTTTTNTTT
GTTTAGNAATANATANTAATTGTNTATTATAAAANNAATNAATTAATNANAATTAAATNANTAGATAANAANTAANAAATTGATTTNAATATTATNANAA
TTTNTAANAATTNANGTGATTTANNTATTNTGTATTTTTTTTTNATATGNTNATNATTAAATAAATTATGNANANATATATATANTTTATTATATAATAT
TGTTATATGTTTATATNTATGTGNAGAATNAAGAAGATTAAAGGAGAAAANTTANNTAGNAGTTTGTAAGTTGNANAAAAANNTTTTGNNNTTTTTNTTT
TTTTTTTTATTTTNGTTATTTATTTTTTTTGAATTATTTAAGTANTAAAAGTGTTAGGTTTTANNNANATATTTAATTAAATAAAGGNTAAATAGTATAG
GGTTTTAAATAAATTATNANTTTAGNTNATAAAATATNGATTAATTAATTTAAGTTAAATAAATATTTAAAATNTTAAAGATGAGTTTTTGGGTTATTAT
AGAGTGTTANGTTTTGAAATATAGTAGTAGAGGAGTGGAGTGTTANGTATTGANATAAGAATAAAGGTGATGAATTATGAAAGATGTTAATATATTNAAT
TTAATGAANTTAATTNTNAAATAAGTATGATATAGAGGTTTGAGTNNTTATGAATGTATTTGATGTTATTTATNAAAGA
>LE_HBa0244F11_T7_378873 (trimmed for quality and cloning vector)
TTGAATTATAATGTTATAATATTTATGAAAATTGTTTTGTNTTTTCCCCCTTTTGTTTTTNTTTGTTTAGNAATANATANTAATTGTNTATTATAAAANN
AATNAATTAATNANAATTAAATNANTAGATAANAANTAANAAATTGATTTNAATATTATNANAATTTNTAANAATTNANGTGATTTANNTATTNTGTATT
TTTTTTTNATATGNTNATNATTAAATAAATTATGNANANATATATATANTTTATTATATAATATTGTTATATGTTTATATNTATGTGNAGAATNAAGAAG
ATTAAAGGAGAAAANTTANNTAGNAGTTTGTAAGTTGNANAAAAANNTTTTGNNNTTTTTNTTTTTTTTTTTATTTTNGTTATTTATTTTTTTTGAATTA
TTTAAGTANTAAAAGTGTTAGGTTTTANNNANATATTTAATTAAATAAAGGNTAAATAGTATAGGGTTTTAAATAAATTATNANTTTAGNTNATAAAATA
TNGATTAATTAATTTAAGTTAAATAAATAT

This is probably not a useful sequence.

Problems:
  • High predicted error rate
Warnings:
  • Not screened for chimera
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for contaminants
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.872888
Expected error %
22.0484
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0244F11
Clone
Clone name
hba-244f11
LE_HBa0244F11
C06HBa0244F11
P244F11
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
128,987
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found