Clone Read LE_HBa0244J04_SP6_379264

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0244J04_SP6_379264
Primer
SP6
ID from Seq. Facility
LE_HBa_244_J04-SP6
Chromatogram
[download]
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
628 trimmed for vector and quality, 834 raw
Sequence
>LE_HBa0244J04_SP6_379264 (raw untrimmed)
GGATTGGGGGATGACAGGGTGGATTCATGTTAAATCATCAACAATTCTTTAATGTATGAGTTCTATTCACCTTTGCGATCCTTTCCTCAAAGGTTTCCTT
CAAAATAGATTTCAAAACGTTGATTTCTCTTATAGGTTTCATTCAATTACGAAATTGAAGCTATGGATTGAGTTGTTAATGAATTCTTAGGGATATATTG
AGTAGATTAACATGTAATTCAACTTGATTATCGTAATTATTGATGTTTTTGTCTAAATTGAAGAGTATGATCCTTTAAATTTAACCCTAGGTGGTGATCT
TGACCTATATTGTATTGTGATCATTCAATTGAGTTGGTTATTGATTTGATTACTGTCCTGTTGTGTTTTTATGATTAAATTAAGATGAATTATATTCCTA
TCATGCTAGTTCTTGAGATGTGATTTAGGTTATGAATTATAATGTGAAATTAGCCTAAGTACCTTGTTTTAAGTTTTGATTTAAAGATGAATTGTGTTAT
AGAGCTGCAATTGGCCTTGTTATATTATTGGTTATCATTGTGTGATGATGTTACTTCTCAGGTTGGTCAGATTTATGAGTTTATGGTAAGACCTTAATGA
TAAACTATGAGGAAGACTTGGAAAGTCTTAGAATCTCTATCTTTACTTCCAATTGTGATTAATTATTGTTAAGTCATGATATTACATATGAATATGCCTT
AATATTAGGAATTATAGGATGGTATGATGCTTAATTTAAATGTCATGAATATGTTGTGAAGTTGATTATAGGTTATGTGCTTTCGGGTTGTTGAAAAATT
TCTTAGTGTTCTTAAATTTGTTTATACAATGCTA
>LE_HBa0244J04_SP6_379264 (trimmed for quality and cloning vector)
GATTGGGGGATGACAGGGTGGATTCATGTTAAATCATCAACAATTCTTTAATGTATGAGTTCTATTCACCTTTGCGATCCTTTCCTCAAAGGTTTCCTTC
AAAATAGATTTCAAAACGTTGATTTCTCTTATAGGTTTCATTCAATTACGAAATTGAAGCTATGGATTGAGTTGTTAATGAATTCTTAGGGATATATTGA
GTAGATTAACATGTAATTCAACTTGATTATCGTAATTATTGATGTTTTTGTCTAAATTGAAGAGTATGATCCTTTAAATTTAACCCTAGGTGGTGATCTT
GACCTATATTGTATTGTGATCATTCAATTGAGTTGGTTATTGATTTGATTACTGTCCTGTTGTGTTTTTATGATTAAATTAAGATGAATTATATTCCTAT
CATGCTAGTTCTTGAGATGTGATTTAGGTTATGAATTATAATGTGAAATTAGCCTAAGTACCTTGTTTTAAGTTTTGATTTAAAGATGAATTGTGTTATA
GAGCTGCAATTGGCCTTGTTATATTATTGGTTATCATTGTGTGATGATGTTACTTCTCAGGTTGGTCAGATTTATGAGTTTATGGTAAGACCTTAATGAT
AAACTATGAGGAAGACTTGGAAAGTCTT

Warnings:
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for chimera
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.914236
Expected error %
0.152071
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0244J04
Clone
Clone name
hba-244j4
LE_HBa0244J04
C12HBa0244J04
P244J04
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
101,238
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
pBeloBAC11
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found