Clone Read LE_HBa0216E11_SP6_390676

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0216E11_SP6_390676
Primer
SP6
ID from Seq. Facility
LE_HBa_216_E11-SP6
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
871 trimmed for vector and quality, 995 raw
Sequence
>LE_HBa0216E11_SP6_390676 (raw untrimmed)
AACAGATCTATCATAGATCAAAATTATCTTTGTCAACTTTTATAATATATAATAAAAAGTACTTTTTGTTTTTATTTATTTATATGCGTTAATATAAATT
TAAAATTTATTTTAAATTGAGAAAGTAATCTAACAGAAATATCGTGACAGAAGGTGGAGGCCAGAGTTTTATCAAAAGGGATTTAGAATATAATAAATTA
ATCACTTAAAAAAACAAATTAAAGTTTCCATCTTTAATACATATACAAAAAAAAATTAATTTTAATCATATATGATTAATATAAGGCTTTCTTAAATATG
TTTTGATATAAACGACAAATTGTGAAACCCACATTTATAGTCATTTTCGTTGAACTATAATCGCAAATTATAATTAATTAAATTGTAGTTGTGATGCATA
ATTAACAACTAGTGTCACTTAGTTGTGTGATTTCCCCAAAATTTTATATACACAATTAATTATTTAAGCCTCTTAACATTAACAACATTATTAATTATTT
TGACATAAACTAATTATTTAAAGATAAAGACTAATTATGTCAACTAATTTCCGATTTTTAAGAAAACAGAATGTATTTATAATTTGAACACTATTTTAGA
GTAAAGCCACCAATATTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAATTAAGTAACAAAACAAATTTATACTATTTAATTATTCATCATAATTATAGTTTGCTATAATT
ATCACTCGCGACTAACATTATACATTGATTACGTGGGCTGACTTTGAGTTTGTATAATTAGTTACGTTCGTCAGAATATACAAATACATATGTATAATAT
ATAATTATTTAACCTATATACATACACAATTCATCTCTCTCCCACTCTCTGCCTTCTCTCGGCTCGCTTCTCTCCTCCCTCTCTCAACCTCGCTCGCCTC
TCTCCTCCCTCTAAAAATTCGCTTGCCCAATATACCGATGCATATGTATAGTATACAATTATATACATATACAAATCACGTCCTCTCCCCTCTCC
>LE_HBa0216E11_SP6_390676 (trimmed for quality and cloning vector)
TATCATAGATCAAAATTATCTTTGTCAACTTTTATAATATATAATAAAAAGTACTTTTTGTTTTTATTTATTTATATGCGTTAATATAAATTTAAAATTT
ATTTTAAATTGAGAAAGTAATCTAACAGAAATATCGTGACAGAAGGTGGAGGCCAGAGTTTTATCAAAAGGGATTTAGAATATAATAAATTAATCACTTA
AAAAAACAAATTAAAGTTTCCATCTTTAATACATATACAAAAAAAAATTAATTTTAATCATATATGATTAATATAAGGCTTTCTTAAATATGTTTTGATA
TAAACGACAAATTGTGAAACCCACATTTATAGTCATTTTCGTTGAACTATAATCGCAAATTATAATTAATTAAATTGTAGTTGTGATGCATAATTAACAA
CTAGTGTCACTTAGTTGTGTGATTTCCCCAAAATTTTATATACACAATTAATTATTTAAGCCTCTTAACATTAACAACATTATTAATTATTTTGACATAA
ACTAATTATTTAAAGATAAAGACTAATTATGTCAACTAATTTCCGATTTTTAAGAAAACAGAATGTATTTATAATTTGAACACTATTTTAGAGTAAAGCC
ACCAATATTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAATTAAGTAACAAAACAAATTTATACTATTTAATTATTCATCATAATTATAGTTTGCTATAATTATCACTCG
CGACTAACATTATACATTGATTACGTGGGCTGACTTTGAGTTTGTATAATTAGTTACGTTCGTCAGAATATACAAATACATATGTATAATATATAATTAT
TTAACCTATATACATACACAATTCATCTCTCTCCCACTCTCTGCCTTCTCTCGGCTCGCTTCTCTCCTCCC

Warnings:
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for chimera
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.892569
Expected error %
0.249414
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0216E11
Clone
Clone name
hba-216e11
LE_HBa0216E11
P216E11
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
112,112
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found