Clone Read LE_HBa0003A06_T7_53387

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0003A06_T7_53387
Primer
T7
ID from Seq. Facility
LE_HBa_003_A06-T7
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
754 trimmed for vector and quality, 815 raw
Genbank Accession
Sequence
>LE_HBa0003A06_T7_53387 (raw untrimmed)
AGGGATCTCTAGAGTCGACATACTGGACCGGGGATCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGTTTGTAGTTATTATAAAATGGCTTTTAGGTTAT
AATAATCTTCANATGTTTGAATTTATTTTAACTTGGAGCTTATATACGATTCAAACTTGTTGTTCTAATTAATTGATTTTGCTCATTTTTCTCGTACAAG
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>LE_HBa0003A06_T7_53387 (trimmed for quality and cloning vector)
AGCTTGTTTGTAGTTATTATAAAATGGCTTTTAGGTTATAATAATCTTCANATGTTTGAATTTATTTTAACTTGGAGCTTATATACGATTCAAACTTGTT
GTTCTAATTAATTGATTTTGCTCATTTTTCTCGTACAAGTCAAGTTCAGATTATATTTATGATTATTAATAATTATTTTTTGTTAATGCATTTGGTTCAT
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AAACTTATTAAATAATTAAAATATTATTTTAAATTTGCGACTACCCGTAGTCGA

Warnings:
  • Not screened for chimera
  • Not screened for repetitive elements
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
5' read, flanking vector found
Quality trim threshold
12.5
Sequence entropy
0.927194
Expected error %
0.852386
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0003A06
Clone
Clone name
hba-3a6
LE_HBa0003A06
C03HBa0003A06
P003A06
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
113,774
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

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1 sequencing reads found