Clone Read LE_HBa0154A04_T7_74887

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0154A04_T7_74887
Primer
T7
ID from Seq. Facility
LE_HBa_154_A04-T7
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
689 trimmed for vector and quality, 923 raw
Genbank Accession
Sequence
>LE_HBa0154A04_T7_74887 (raw untrimmed)
CTGCCTGGGTACGGGGGGGTCCTCTGGAGTTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTTTTAATTTTTACTTTTTGTCCCTTTTGGGGTTTCTTGTTCACTTTCT
CTCTCTTGCTGTAGCCTTTTTTGCGTTTATTTCTCATTAATTAATTAATTAGAAAAATAATTTAAGGCATGATAAATTGTAAATAAATTAAATTTAGATT
AATAATGTATTACGCACATATTAAAATCAAACTATAAGAGAATTAAGCATGAATGTAAAATGTAGCAAACGAAAGAGTATTTCATGTTTTGTAAACTGAA
TGAATATGTATCAATAATGAATTTTACAAGTAATTCAATCGTAACAAATTAATAAAAGAATTGCAAAACGAACTAAAATTATATTTAAAAGTGTATTGCA
CAAATATTAAAATTGCATTGGAAGAGAGAATTAAGCATGAATAAAAACATAACTAATGAATAACCAAACAATTATTCATAGAGTAAATTAAATTTGTATC
AATAATGACTTAAACAAATAAATTCAATAGTAACAAATAAATCAAAAAATTGCAAAATGAATTAAATTGCTTTAAAATTGTATTAGACAATTTTAAACTT
GTATTAGAAGAGAGAATTAAGAATGAATGAAAAACGTAACTAATGAAAGACAAGACAACGATCTATAAATTGAATTAAACTCATATGGTTCATGAATAAA
ACTTATATCATAATATATCTGATAAATTATATTTGCTTTTATCATTGACAAAATGTGTGATAGTTGCAATATGTTTTCAAAAATATATTGTCCATTGGTT
GGAAGGTATTATAGTGTGGTACATAAATTATTCTGGTGGGACTCCGTAGAAAGTGGGGGGAAAAATACAGAGGGGCGTAAAAGGTTGTGTGACAACTAAA
AATTGGGTGTGGTGGTGGTTTAA
>LE_HBa0154A04_T7_74887 (trimmed for quality and cloning vector)
CCTGCAGGCATGCAAGCTTTTTAATTTTTACTTTTTGTCCCTTTTGGGGTTTCTTGTTCACTTTCTCTCTCTTGCTGTAGCCTTTTTTGCGTTTATTTCT
CATTAATTAATTAATTAGAAAAATAATTTAAGGCATGATAAATTGTAAATAAATTAAATTTAGATTAATAATGTATTACGCACATATTAAAATCAAACTA
TAAGAGAATTAAGCATGAATGTAAAATGTAGCAAACGAAAGAGTATTTCATGTTTTGTAAACTGAATGAATATGTATCAATAATGAATTTTACAAGTAAT
TCAATCGTAACAAATTAATAAAAGAATTGCAAAACGAACTAAAATTATATTTAAAAGTGTATTGCACAAATATTAAAATTGCATTGGAAGAGAGAATTAA
GCATGAATAAAAACATAACTAATGAATAACCAAACAATTATTCATAGAGTAAATTAAATTTGTATCAATAATGACTTAAACAAATAAATTCAATAGTAAC
AAATAAATCAAAAAATTGCAAAATGAATTAAATTGCTTTAAAATTGTATTAGACAATTTTAAACTTGTATTAGAAGAGAGAATTAAGAATGAATGAAAAA
CGTAACTAATGAAAGACAAGACAACGATCTATAAATTGAATTAAACTCATATGGTTCATGAATAAAACTTATATCATAATATATCTGAT

Warnings:
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for chimera
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.873226
Expected error %
0.601242
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0154A04
Clone
Clone name
hba-154a4
LE_HBa0154A04
P154A04
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
111,485
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found